RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 SFRP1Q8N474 314 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 DDHD1Q8NEL9 900 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 OR13J1Q8NGT2 312 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 DTX3LQ8TDB6 740 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 NAT6Q93015 286 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 SGF29Q96ES7 293 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 ALS2CR12Q96Q35 445 aa6.9□□□□□ -1.3
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RABGEF1-206ENST00000461017 NRSN2Q9GZP1 204 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 CDH19Q9H159 772 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 ABCG4Q9H172 646 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 ASB8Q9H765 288 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 RMI1Q9H9A7 625 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 RDH14Q9HBH5 336 aa6.9□□□□□ -1.3
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RABGEF1-206ENST00000461017 AK5Q9Y6K8 562 aa6.9□□□□□ -1.3
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RABGEF1-206ENST00000461017 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa6.89□□□□□ -1.31
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RABGEF1-206ENST00000461017 C2orf81A6NN90 581 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 RHPN2P1A8MT19 583 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 D6RAR5 112 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 H7C0S8 307 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 KMOO15229 486 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 VEGFDO43915 354 aa6.89□□□□□ -1.31
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RABGEF1-206ENST00000461017 F3P13726 295 aa6.89□□□□□ -1.31
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RABGEF1-206ENST00000461017 FASLGP48023 281 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 DRG2P55039 364 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
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RABGEF1-206ENST00000461017 GABREP78334 506 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 CRADDP78560 199 aa6.89□□□□□ -1.31
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RABGEF1-206ENST00000461017 SEPT6Q14141 434 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 SPIDRQ14159 915 aa6.89□□□□□ -1.31
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RABGEF1-206ENST00000461017 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
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RABGEF1-206ENST00000461017 C19orf48Q6RUI8 117 aa6.89□□□□□ -1.31
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RABGEF1-206ENST00000461017 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP6.89□□□□□ -1.31
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RABGEF1-206ENST00000461017 GDAP1Q8TB36 358 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 STYXQ8WUJ0 223 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
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RABGEF1-206ENST00000461017 SMOXQ9NWM0 555 aa6.89□□□□□ -1.31
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RABGEF1-206ENST00000461017 PAK5Q9P286 719 aa6.89□□□□□ -1.31
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RABGEF1-206ENST00000461017 FER1L5A0AVI2 2057 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 SEC16AO15027 2179 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM8BA6NDV4 472 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 CDRT15L2A8MXV6 281 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 PSMD3O43242 534 aa6.88□□□□□ -1.31
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