RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431908.5

DDX39B-210, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 5

Gene DDX39B, Length 914 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-210ENST00000431908 PRR19A6NJB7 356 aa11.66□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 MTSS1O43312 755 aa11.66□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 PMPCBO75439 489 aa11.66□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 KIAA0754O94854 1291 aa11.66□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 GYPCP04921 128 aa11.66□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 TMEM253P0C7T8 217 aa11.66□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 OAS2P29728 719 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 NR2C2P49116 596 aa11.66□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 PDE1BQ01064 536 aa11.66□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 TRIM14Q14142 442 aa11.66□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 ERV3-1Q14264 604 aa11.66□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 TEX44Q53QW1 395 aa11.66□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 AGAP9Q5VTM2 703 aa11.66□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 WASH2PQ6VEQ5 465 aa11.66□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 PLD5Q8N7P1 536 aa11.66□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 CNTD1Q8N815 330 aa11.66□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 GALNT6Q8NCL4 622 aa11.66□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 OR8K1Q8NGG5 319 aa11.66□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 SLC35G2Q8TBE7 412 aa11.66□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 ELMO2Q96JJ3 720 aa11.66□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 VPS35Q96QK1 796 aa11.66□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 CEP41Q9BYV8 373 aa11.66□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 TRABDQ9H4I3 376 aa11.66□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 SLC40A1Q9NP59 571 aa11.66□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 WASH6PQ9NQA3 447 aa11.66□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 KCND1Q9NSA2 647 aa11.66□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 HACD3Q9P035 362 aa11.66□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 TRIM10Q9UDY6 481 aa11.66□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 CROTQ9UKG9 612 aa11.66□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 RARRES3Q9UL19 164 aa11.66□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 ADGRG1Q9Y653 693 aa11.66□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 PIPSLA2A3N6 862 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 CBFA2T2O43439 604 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 RRP9O43818 475 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 MTX2O75431 263 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 KRT1P04264 644 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 FGF5P12034 268 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 TNNT1P13805 278 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 BPIP17213 487 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 HMGCLP35914 325 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 SLC1A1P43005 524 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 CAPZBP47756 277 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 DRG2P55039 364 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 DYNLT1P63172 113 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 ITGA9Q13797 1035 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 TFDP2Q14188 446 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 GPR18Q14330 331 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 PLCL1Q15111 1095 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 PPP2R5EQ16537 467 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP11.65□□□□□ -0.541e-30■■□□□ 13.8
DDX39B-210ENST00000431908 LDLRAP1Q5SW96 308 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 SLC9A4Q6AI14 798 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 ARMC6Q6NXE6 501 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 FAM92BQ6ZTR7 304 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 PRSS42Q7Z5A4 293 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 AMZ2Q86W34 360 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 LRRC8AQ8IWT6 810 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 RHOT1Q8IXI2 618 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 UBXN4Q92575 508 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 CCDC42Q96M95 316 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 TRIB3Q96RU7 358 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 FERMT1Q9BQL6 677 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 TWSG1Q9GZX9 223 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 RAB33BQ9H082 229 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 GLOD4Q9HC38 313 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 BPIFA1Q9NP55 256 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 EPHA6Q9UF33 1036 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 SLC23A2Q9UGH3 650 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 FAM153AQ9UHL3 310 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 PKP3Q9Y446 797 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 KCNMB2Q9Y691 235 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa11.64□□□□□ -0.55
DDX39B-210ENST00000431908 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
DDX39B-210ENST00000431908 CDC14CA4D256 554 aa11.64□□□□□ -0.55
DDX39B-210ENST00000431908 OR52A4PA6NMU1 304 aa11.64□□□□□ -0.55
DDX39B-210ENST00000431908 SPOPO43791 374 aa11.64□□□□□ -0.55
DDX39B-210ENST00000431908 SPAG6O75602 509 aa11.64□□□□□ -0.55
DDX39B-210ENST00000431908 CREG1O75629 220 aa11.64□□□□□ -0.55
DDX39B-210ENST00000431908 RFPL1O75677 317 aa11.64□□□□□ -0.55
DDX39B-210ENST00000431908 RECKO95980 971 aa11.64□□□□□ -0.55
DDX39B-210ENST00000431908 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
DDX39B-210ENST00000431908 NTRK1P04629 796 aa11.64□□□□□ -0.55
DDX39B-210ENST00000431908 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
DDX39B-210ENST00000431908 RPS15P62841 145 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
DDX39B-210ENST00000431908 SH3BP2P78314 561 aa11.64□□□□□ -0.55
DDX39B-210ENST00000431908 FOXK1P85037 733 aa11.64□□□□□ -0.55
DDX39B-210ENST00000431908 ACY1Q03154 408 aa11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms