RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429295.1

MRPL23-206, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L23, humanhuman

TSL 5

Gene MRPL23, Length 805 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL23-206ENST00000429295 B3GNT4Q9C0J1 378 aa21.6■■□□□ 1.05
MRPL23-206ENST00000429295 TMEM9Q9P0T7 183 aa21.6■■□□□ 1.05
MRPL23-206ENST00000429295 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
MRPL23-206ENST00000429295 A0A0U1RQJ8 604 aa21.59■■□□□ 1.05
MRPL23-206ENST00000429295 C2orf81A6NN90 581 aa21.59■■□□□ 1.05
MRPL23-206ENST00000429295 UGT1A9O60656 530 aa21.59■■□□□ 1.05
MRPL23-206ENST00000429295 FTCDO95954 541 aa21.59■■□□□ 1.05
MRPL23-206ENST00000429295 LIPCP11150 499 aa21.59■■□□□ 1.05
MRPL23-206ENST00000429295 CCL4P13236 92 aa21.59■■□□□ 1.05
MRPL23-206ENST00000429295 VCLP18206 1134 aa21.59■■□□□ 1.05
MRPL23-206ENST00000429295 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
MRPL23-206ENST00000429295 UGT1A6P19224 532 aa21.59■■□□□ 1.05
MRPL23-206ENST00000429295 UGT1A1P22309 533 aa21.59■■□□□ 1.05
MRPL23-206ENST00000429295 UGT1A4P22310 534 aa21.59■■□□□ 1.05
MRPL23-206ENST00000429295 ADRA1AP35348 466 aa21.59■■□□□ 1.05
MRPL23-206ENST00000429295 UGT1A3P35503 534 aa21.59■■□□□ 1.05
MRPL23-206ENST00000429295 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
MRPL23-206ENST00000429295 TGIF1Q15583 401 aa21.59■■□□□ 1.05
MRPL23-206ENST00000429295 LDLRAP1Q5SW96 308 aa21.59■■□□□ 1.05
MRPL23-206ENST00000429295 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
MRPL23-206ENST00000429295 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa21.59■■□□□ 1.05
MRPL23-206ENST00000429295 NCSTNQ92542 709 aa21.59■■□□□ 1.05
MRPL23-206ENST00000429295 EPB41L1Q9H4G0 881 aa21.59■■□□□ 1.05
MRPL23-206ENST00000429295 UGT1A7Q9HAW7 530 aa21.59■■□□□ 1.05
MRPL23-206ENST00000429295 UGT1A10Q9HAW8 530 aa21.59■■□□□ 1.05
MRPL23-206ENST00000429295 UGT1A8Q9HAW9 530 aa21.59■■□□□ 1.05
MRPL23-206ENST00000429295 PDP2Q9P2J9 529 aa21.59■■□□□ 1.05
MRPL23-206ENST00000429295 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
MRPL23-206ENST00000429295 ARL5AQ9Y689 179 aa21.59■■□□□ 1.05
MRPL23-206ENST00000429295 MYO18BQ8IUG5 2567 aa21.58■■□□□ 1.05
MRPL23-206ENST00000429295 C5orf60A6NFR6 353 aa21.58■■□□□ 1.05
MRPL23-206ENST00000429295 PDZK1P1A8MUH7 402 aa21.58■■□□□ 1.05
MRPL23-206ENST00000429295 C9orf172C9J069 976 aa21.58■■□□□ 1.05
MRPL23-206ENST00000429295 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa21.58■■□□□ 1.05
MRPL23-206ENST00000429295 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
MRPL23-206ENST00000429295 VIPP01282 170 aa21.58■■□□□ 1.05
MRPL23-206ENST00000429295 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
MRPL23-206ENST00000429295 LPOP22079 712 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
MRPL23-206ENST00000429295 IDSP22304 550 aa21.58■■□□□ 1.05
MRPL23-206ENST00000429295 CD82P27701 267 aa21.58■■□□□ 1.05
MRPL23-206ENST00000429295 MAPK9P45984 424 aa21.58■■□□□ 1.05
MRPL23-206ENST00000429295 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
MRPL23-206ENST00000429295 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
MRPL23-206ENST00000429295 MANEAQ5SRI9 462 aa21.58■■□□□ 1.05
MRPL23-206ENST00000429295 TRIM48Q8IWZ4 208 aa21.58■■□□□ 1.05
MRPL23-206ENST00000429295 CCDC112Q8NEF3 446 aa21.58■■□□□ 1.05
MRPL23-206ENST00000429295 LRRC45Q96CN5 670 aa21.58■■□□□ 1.05
MRPL23-206ENST00000429295 SGF29Q96ES7 293 aa21.58■■□□□ 1.05
MRPL23-206ENST00000429295 TAAR9Q96RI9 348 aa21.58■■□□□ 1.05
MRPL23-206ENST00000429295 APOL2Q9BQE5 337 aa21.58■■□□□ 1.05
MRPL23-206ENST00000429295 FAM117AQ9C073 453 aa21.58■■□□□ 1.05
MRPL23-206ENST00000429295 FOXJ2Q9P0K8 574 aa21.58■■□□□ 1.05
MRPL23-206ENST00000429295 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
MRPL23-206ENST00000429295 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
MRPL23-206ENST00000429295 KCNJ13O60928 360 aa21.57■■□□□ 1.04
MRPL23-206ENST00000429295 PTPRCAPQ14761 206 aa21.57■■□□□ 1.04
MRPL23-206ENST00000429295 SNAP47Q5SQN1 464 aa21.57■■□□□ 1.04
MRPL23-206ENST00000429295 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa21.57■■□□□ 1.04
MRPL23-206ENST00000429295 WASH2PQ6VEQ5 465 aa21.57■■□□□ 1.04
MRPL23-206ENST00000429295 C11orf96Q7Z7L8 435 aa21.57■■□□□ 1.04
MRPL23-206ENST00000429295 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
MRPL23-206ENST00000429295 DDHD1Q8NEL9 900 aa21.57■■□□□ 1.04
MRPL23-206ENST00000429295 ZNF398Q8TD17 642 aa21.57■■□□□ 1.04
MRPL23-206ENST00000429295 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa21.57■■□□□ 1.04
MRPL23-206ENST00000429295 UCK1Q9HA47 277 aa21.57■■□□□ 1.04
MRPL23-206ENST00000429295 WASH6PQ9NQA3 447 aa21.57■■□□□ 1.04
MRPL23-206ENST00000429295 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa21.57■■□□□ 1.04
MRPL23-206ENST00000429295 LILRA5A6NI73 299 aa21.56■■□□□ 1.04
MRPL23-206ENST00000429295 PRR19A6NJB7 356 aa21.56■■□□□ 1.04
MRPL23-206ENST00000429295 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
MRPL23-206ENST00000429295 GPR39O43194 453 aa21.56■■□□□ 1.04
MRPL23-206ENST00000429295 RPL10P27635 214 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
MRPL23-206ENST00000429295 SLC19A1P41440 591 aa21.56■■□□□ 1.04
MRPL23-206ENST00000429295 PDE1BQ01064 536 aa21.56■■□□□ 1.04
MRPL23-206ENST00000429295 NFATC3Q12968 1075 aa21.56■■□□□ 1.04
MRPL23-206ENST00000429295 OLIG2Q13516 323 aa21.56■■□□□ 1.04
MRPL23-206ENST00000429295 GPRC6AQ5T6X5 926 aa21.56■■□□□ 1.04
MRPL23-206ENST00000429295 AGAP9Q5VTM2 703 aa21.56■■□□□ 1.04
MRPL23-206ENST00000429295 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa21.56■■□□□ 1.04
MRPL23-206ENST00000429295 AMZ2Q86W34 360 aa21.56■■□□□ 1.04
MRPL23-206ENST00000429295 ZFAND4Q86XD8 727 aa21.56■■□□□ 1.04
MRPL23-206ENST00000429295 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa21.56■■□□□ 1.04
MRPL23-206ENST00000429295 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa21.56■■□□□ 1.04
MRPL23-206ENST00000429295 OR4K2Q8NGD2 314 aa21.56■■□□□ 1.04
MRPL23-206ENST00000429295 HES6Q96HZ4 224 aa21.56■■□□□ 1.04
MRPL23-206ENST00000429295 TBL1YQ9BQ87 522 aa21.56■■□□□ 1.04
MRPL23-206ENST00000429295 CLMPQ9H6B4 373 aa21.56■■□□□ 1.04
MRPL23-206ENST00000429295 SMOXQ9NWM0 555 aa21.56■■□□□ 1.04
MRPL23-206ENST00000429295 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
MRPL23-206ENST00000429295 A8MU76 341 aa21.55■■□□□ 1.04
MRPL23-206ENST00000429295 EFSO43281 561 aa21.55■■□□□ 1.04
MRPL23-206ENST00000429295 POP7O75817 140 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
MRPL23-206ENST00000429295 PRAMEF1O95521 474 aa21.55■■□□□ 1.04
MRPL23-206ENST00000429295 CRTAMO95727 393 aa21.55■■□□□ 1.04
MRPL23-206ENST00000429295 MSH3P20585 1137 aa21.55■■□□□ 1.04
MRPL23-206ENST00000429295 DRG2P55039 364 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
MRPL23-206ENST00000429295 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
MRPL23-206ENST00000429295 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
MRPL23-206ENST00000429295 PARP6Q2NL67 630 aa21.55■■□□□ 1.04
MRPL23-206ENST00000429295 TMEM220Q6QAJ8 160 aa21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms