RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414558.2

ATG4C-204, Transcript of autophagy related 4C cysteine peptidase, human

TSL 5

Gene ATG4C, Length 464 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4C-204	ENST00000414558	MSH3	P20585	1137 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	HIST1H2AD	P20671	130 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	NAXE	Q8NCW5	288 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	WDFY2	Q96P53	400 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	OGFR	Q9NZT2	677 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	SCAMP1	O15126	338 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	TSHB	P01222	138 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	IGLV1-44	P01699	117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	GNB3	P16520	340 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	GNAZ	P19086	355 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	SMPDL3B	Q92485	455 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	MTMR6	Q9Y217	621 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG4C-204	ENST00000414558	DUXA	A6NLW8	204 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	PSMD14	O00487	310 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	ZBTB43	O43298	467 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	TMCC2	O75069	709 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	ACTN1	P12814	892 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	TMEM11	P17152	192 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	HRH2	P25021	359 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	KRT9	P35527	623 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	C1orf74	Q96LT6	269 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	PPM1M	Q96MI6	270 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	PLPP2	O43688	288 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	KRT5	P13647	590 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	ACADL	P28330	430 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	TAF6	P49848	677 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	MMP15	P51511	669 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	GPR143	P51810	404 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	GALC	P54803	685 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	CD81	P60033	236 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	PTOV1	Q86YD1	416 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	C7orf26	Q96N11	449 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	PSD2	Q9BQI7	771 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	NR5A2	O00482	541 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	OGG1	O15527	345 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	ZNF217	O75362	1048 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	GPC4	O75487	556 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	CD48	P09326	243 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	NFKBIA	P25963	317 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	MSH2	P43246	934 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	SPOCK1	Q08629	439 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	4.81	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	ITGA9	Q13797	1035 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	MED22	Q15528	200 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	ALF	Q53S48	1182 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	SARM1	Q6SZW1	724 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	TMTC2	Q8N394	836 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4C-204	ENST00000414558	MOAP1	Q96BY2	351 aa		4.81	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.1 ms