RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM106CPP0CH98 169 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 NR2F1P10589 423 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 HLA-DOBP13765 273 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 NMBRP28336 390 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 TKTP29401 623 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRT20P35900 424 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 IL15P40933 162 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 HSD17B4P51659 736 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 CD81P60033 236 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 ISL1P61371 349 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 COASYQ13057 564 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 BMP2KLQ5H9B9 411 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR7E24Q6IFN5 339 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMCO3Q6UWJ1 677 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRSS57Q6UWY2 283 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 RAD9BQ6WBX8 426 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 ASB18Q6ZVZ8 466 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 Q75L30 129 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 ADGRA1Q86SQ6 560 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 SATL1Q86VE3 508 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMPRSS12Q86WS5 348 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 KMT5CQ86Y97 462 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 AFAP1Q8N556 730 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 MINDY1Q8N5J2 469 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 PHF21AQ96BD5 680 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 ABHD1Q96SE0 405 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 GFI1Q99684 422 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLF1Q9BQI6 1058 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 NEURL2Q9BR09 285 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 CENPOQ9BU64 300 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 APOL6Q9BWW8 343 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPATC1LQ9H0A9 340 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRMDAQ9H2I8 198 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 RETREG1Q9H6L5 497 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRRC4Q9HBW1 653 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 MORF4L1Q9UBU8 362 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 TSPYL4Q9UJ04 414 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 HACL1Q9UJ83 578 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 POU2F3Q9UKI9 436 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 CGNL1Q0VF96 1302 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANKRD66B4E2M5 251 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 H0YIN7 160 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 J3QR06 171 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLK4O00444 970 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 ADAMDEC1O15204 470 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 P4HA2O15460 535 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 TIMM44O43615 452 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 WDR1O75083 606 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 TPOP07202 933 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 CDH1P12830 882 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 GJA1P17302 382 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 LIG4P49917 911 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 SIRPAP78324 504 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 RUNX1T1Q06455 604 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 GRAPQ13588 217 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 GTF2H2Q13888 395 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGSF11Q5DX21 431 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC30A6Q6NXT4 461 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPSB3Q6PJ21 355 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 TUBA1AQ71U36 451 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF534Q76KX8 674 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 CEP97Q8IW35 865 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 NAGSQ8N159 534 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR8H2Q8N162 312 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR52I2Q8NH67 350 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-78P-201ENST00000362897 LMO3Q8TAP4 145 aa2.62□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.1 ms