RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 CPA6Q8N4T0 437 aa20.53■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
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NISCH-201ENST00000345716 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa20.53■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 AIF1LQ9BQI0 150 aa20.53■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 CLN6Q9NWW5 311 aa20.53■□□□□ 0.88
NISCH-201ENST00000345716 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa20.53■□□□□ 0.88
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NISCH-201ENST00000345716 PEX2P28328 305 aa20.51■□□□□ 0.87
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NISCH-201ENST00000345716 ZNF607Q96SK3 696 aa20.51■□□□□ 0.87
NISCH-201ENST00000345716 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
NISCH-201ENST00000345716 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa20.51■□□□□ 0.87
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NISCH-201ENST00000345716 MT-ND1P03886 318 aa20.51■□□□□ 0.87
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NISCH-201ENST00000345716 LSM3P62310 102 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
NISCH-201ENST00000345716 HERVK_113P63132 956 aa20.51■□□□□ 0.87
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NISCH-201ENST00000345716 SLC5A9Q2M3M2 681 aa20.51■□□□□ 0.87
NISCH-201ENST00000345716 C6orf52Q5T4I8 152 aa20.51■□□□□ 0.87
NISCH-201ENST00000345716 ZNF544Q6NX49 715 aa20.51■□□□□ 0.87
NISCH-201ENST00000345716 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
NISCH-201ENST00000345716 ERVK-6Q9BXR3 956 aa20.51■□□□□ 0.87
NISCH-201ENST00000345716 SLC28A2O43868 658 aa20.5■□□□□ 0.87
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NISCH-201ENST00000345716 ACSBG2Q5FVE4 666 aa20.5■□□□□ 0.87
NISCH-201ENST00000345716 LRRC73Q5JTD7 316 aa20.5■□□□□ 0.87
NISCH-201ENST00000345716 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
NISCH-201ENST00000345716 LIX1Q8N485 282 aa20.5■□□□□ 0.87
NISCH-201ENST00000345716 NUAK2Q9H093 628 aa20.5■□□□□ 0.87
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NISCH-201ENST00000345716 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa20.5■□□□□ 0.87
NISCH-201ENST00000345716 CYTH4Q9UIA0 394 aa20.5■□□□□ 0.87
NISCH-201ENST00000345716 A0A1W2PRU2 124 aa20.5■□□□□ 0.87
NISCH-201ENST00000345716 PDZK1Q5T2W1 519 aa20.5■□□□□ 0.87
NISCH-201ENST00000345716 DEF8Q6ZN54 512 aa20.5■□□□□ 0.87
NISCH-201ENST00000345716 SNX20Q7Z614 316 aa20.5■□□□□ 0.87
NISCH-201ENST00000345716 HAPLN2Q9GZV7 340 aa20.5■□□□□ 0.87
NISCH-201ENST00000345716 AK5Q9Y6K8 562 aa20.5■□□□□ 0.87
NISCH-201ENST00000345716 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa20.5■□□□□ 0.87
NISCH-201ENST00000345716 KLF11O14901 512 aa20.5■□□□□ 0.87
NISCH-201ENST00000345716 SLC22A2O15244 555 aa20.5■□□□□ 0.87
NISCH-201ENST00000345716 UGT2B15P54855 530 aa20.5■□□□□ 0.87
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