RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295874.14

PTPRG-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRG, Length 4,650 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-201ENST00000295874 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 AK5Q9Y6K8 562 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 HAT1O14929 419 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 IRAK2O43187 625 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 DLX3O60479 287 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 RAB25P57735 213 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 IL2P60568 153 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 PTSQ03393 145 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 RALGDSQ12967 914 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 MCEMP1Q8IX19 187 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 METTL6Q8TCB7 284 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 KLHL5Q96PQ7 755 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 SEPHS2Q99611 448 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
PTPRG-201ENST00000295874 H3BN98 237 aa12.21□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 BUD23O43709 281 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 F2P00734 622 aa12.21□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 AHSGP02765 367 aa12.21□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 ASGR1P07306 291 aa12.21□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 PCNAP12004 261 aa12.21□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 COPZ1P61923 177 aa12.21□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 RGS1Q08116 209 aa12.21□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 OLIG2Q13516 323 aa12.21□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF460Q14592 562 aa12.21□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 CTC1Q2NKJ3 1217 aa12.21□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 PLPP4Q5VZY2 271 aa12.21□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 TMEM198Q66K66 360 aa12.21□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 PPP2R2DQ66LE6 453 aa12.21□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 TRNP1Q6NT89 227 aa12.21□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 RPTNQ6XPR3 784 aa12.21□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 TMEM26Q6ZUK4 368 aa12.21□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 OTOP2Q7RTS6 562 aa12.21□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 GPSM1Q86YR5 675 aa12.21□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 TMEM130Q8N3G9 435 aa12.21□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 BBS4Q96RK4 519 aa12.21□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 SLC39A8Q9C0K1 460 aa12.21□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 TBC1D3EA0A087X179 549 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF879B4DU55 563 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 TBC1D3LB9A6J9 549 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 TBC1D3HP0C7X1 549 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 CD52P31358 61 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 ALDH9A1P49189 494 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 UBXN2BQ14CS0 331 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 RAB30Q15771 203 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 SWI5Q1ZZU3 235 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 DDI2Q5TDH0 399 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 AFTPHQ6ULP2 937 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 OR4L1Q8NH43 312 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 CD99L2Q8TCZ2 262 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 STYXQ8WUJ0 223 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 TBC1D14Q9P2M4 693 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 SMCHD1A6NHR9 2005 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 A0A0J9YYE9 177 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 KPNA5O15131 536 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 NFATC1O95644 943 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 ABL2P42684 1182 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 RABGGTBP53611 331 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 PYHIN1Q6K0P9 492 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 AGMOQ6ZNB7 445 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 FAM126BQ8IXS8 530 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 ARNTL2Q8WYA1 636 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 REPS1Q96D71 796 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 SMOQ99835 787 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 ADAMTS10Q9H324 1103 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 QSER1Q2KHR3 1735 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 TAF1LQ8IZX4 1826 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 A0A1W2PQH9 124 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 ARL5CA6NH57 179 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 SCAPQ12770 1279 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 EFR3AQ14156 821 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 CNPY1Q3B7I2 92 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 REP15Q6BDI9 236 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 TXNDC11Q6PKC3 985 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 OR2T34Q8NGX1 318 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 OR2T3Q8NH03 318 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 BTN2A3PQ96KV6 586 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
PTPRG-201ENST00000295874 C8orf4Q9NR00 106 aa12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms