RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294161.10

TTC9C-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 9C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC9C, Length 1,833 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9C-201ENST00000294161 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 K7ERQ8 282 aa14.6□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 ALPIP09923 528 aa14.6□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 SPATA31D3P0C874 917 aa14.6□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 PEX2P28328 305 aa14.6□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 CLCN2P51788 898 aa14.6□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 KCNK10P57789 538 aa14.6□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 MS4A2Q01362 244 aa14.6□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 NFATC2Q13469 925 aa14.6□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 TGFBIQ15582 683 aa14.6□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 FAM151BQ6UXP7 276 aa14.6□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 RNF111Q6ZNA4 994 aa14.6□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa14.6□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 GAREM2Q75VX8 874 aa14.6□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa14.6□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 SPNS2Q8IVW8 549 aa14.6□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 BBS7Q8IWZ6 715 aa14.6□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 MINDY1Q8N5J2 469 aa14.6□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 TTC16Q8NEE8 873 aa14.6□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 BHMTQ93088 406 aa14.6□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 LYSMD1Q96S90 227 aa14.6□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 SLC30A3Q99726 388 aa14.6□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa14.6□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 GALPQ9UBC7 116 aa14.6□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 CRLS1Q9UJA2 301 aa14.6□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 SLC25A13Q9UJS0 675 aa14.6□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 PACSIN3Q9UKS6 424 aa14.6□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 LEFTY2O00292 366 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 GRM6O15303 877 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 CXCL14O95715 111 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 C8AP07357 584 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 C8BP07358 591 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 ACRV1P26436 265 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 HNF1BP35680 557 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 FOXA1P55317 472 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 ERVK-8P63133 956 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 RHDQ02161 417 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 GRB7Q14451 532 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 LRRC36Q1X8D7 754 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 MACC1Q6ZN28 852 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 USP45Q70EL2 814 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 RTL10Q7L3V2 364 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 SYVN1Q86TM6 617 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 TMC8Q8IU68 726 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 TDHQ8IZJ6 230 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 RNF148Q8N7C7 305 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 KREMEN2Q8NCW0 462 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 LRRC3Q9BY71 257 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 CIPCQ9C0C6 399 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 CEP44Q9C0F1 390 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 TUBB1Q9H4B7 451 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 KLHL42Q9P2K6 505 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 CD300AQ9UGN4 299 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 SUN2Q9UH99 717 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 IKZF3Q9UKT9 509 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 E2F3O00716 465 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 PPP6CO00743 305 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 GLUD1P00367 558 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 OTCP00480 354 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 PRR35P0CG20 571 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 CBSLP0DN79 551 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 CTNNB1P35222 781 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 CBSP35520 551 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 ZXDBP98169 803 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 BNIP2Q12982 314 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 MYLK3Q32MK0 819 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 SFT2D3Q587I9 215 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 XKR7Q5GH72 579 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 TTC23LQ6PF05 361 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 LILRA6Q6PI73 481 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 FUNDC1Q8IVP5 155 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 HS6ST3Q8IZP7 471 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 KLHL23Q8NBE8 558 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 GOLM1Q8NBJ4 401 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 ULK4Q96C45 1275 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 ASIC4Q96FT7 647 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 KCNA7Q96RP8 456 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 MUC13Q9H3R2 512 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 IL26Q9NPH9 171 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 AIG1Q9NVV5 245 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 BTRCQ9Y297 605 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 OARD1Q9Y530 152 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC9C-201ENST00000294161 AP4S1Q9Y587 144 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms