RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 ITGA7Q13683 1181 aa20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 C5orf22Q49AR2 442 aa20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 PIK3R6Q5UE93 754 aa20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 MOB2Q70IA6 237 aa20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 OAFQ86UD1 273 aa20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 GJD3Q8N144 294 aa20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 SLC35B2Q8TB61 432 aa20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 LRTOMTQ8WZ04 291 aa20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 CXorf21Q9HAI6 301 aa20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 GOT2P00505 430 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 CREB1P16220 341 aa20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 PTGER3P43115 390 aa20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 C2orf80Q0P641 193 aa20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 DPYSL2Q16555 572 aa20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 NODALQ96S42 347 aa20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 HMGXB4Q9UGU5 601 aa20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 GALK1P51570 392 aa20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 TAS2R39P59534 338 aa20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 RASSF5Q8WWW0 418 aa20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 TREHO43280 583 aa20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 KERAO60938 352 aa20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 ACTR3P61158 418 aa20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 RGMBQ6NW40 437 aa20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 BEND5Q7L4P6 421 aa20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 TCF25Q9BQ70 676 aa20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 DPEP3Q9H4B8 488 aa20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 FAUP35544 74 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 RPS6KA3P51812 740 aa20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 RALGPS1Q5JS13 557 aa20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 PAOXQ6QHF9 649 aa20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 XAGE5Q8WWM1 108 aa20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 FAM83DQ9H4H8 585 aa20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 NMUR1Q9HB89 426 aa20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 DNAJB4Q9UDY4 337 aa20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 FAM92AA1XBS5 289 aa20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 SYN3O14994 580 aa20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 CLCNKBP51801 687 aa20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 FAM171BQ6P995 826 aa20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF730Q6ZMV8 503 aa20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 C10orf82Q8WW14 230 aa20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP20.93■□□□□ 0.942e-7■■■■□ 22.2
CCSAP-201ENST00000284617 GABRDO14764 452 aa20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 PIP5K1BO14986 540 aa20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 CXCL14O95715 111 aa20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 FOXN2P32314 431 aa20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 ADGRE1Q14246 886 aa20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 SNAPC1Q16533 368 aa20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 RGL4Q8IZJ4 473 aa20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 OR4F21O95013 312 aa20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 LAG3P18627 525 aa20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 MYBPC1Q00872 1141 aa20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 MED27Q6P2C8 311 aa20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD23Q86SG2 305 aa20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 P2RY8Q86VZ1 359 aa20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 DNAJB8Q8NHS0 232 aa20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 HMCESQ96FZ2 354 aa20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 PLK2Q9NYY3 685 aa20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM63AO94886 807 aa20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 C22orf31O95567 290 aa20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 SDC2P34741 201 aa20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 SLC18A1P54219 525 aa20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 IL18R1Q13478 541 aa20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 SLC10A6Q3KNW5 377 aa20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 FZD8Q9H461 694 aa20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 BTN3A3O00478 584 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF132P52740 706 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 DLG1Q12959 904 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 RFWD3Q6PCD5 774 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 KLHL35Q6PF15 583 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGEF33A8MVX0 844 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 METTL18O95568 372 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 ASPAP45381 313 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 HPS1Q92902 700 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 MCUBQ9NWR8 336 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 EURLQ9NYK6 297 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 PTTG2Q9NZH5 202 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 PDE10AQ9Y233 779 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 TFECO14948 347 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 MTTPP55157 894 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 GMFBP60983 142 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 TEAD4Q15561 434 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 DCST1Q5T197 706 aa20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms