RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pycr2Q922Q4 320 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Elp3Q9CZX0 547 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 4933425L06RikQ9D3Z8 585 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 S100pbpQ9D5K4 396 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Oser1Q9D722 291 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 P33monoxQ9DBN4 303 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cldn19Q9ET38 224 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc6a14Q9JMA9 638 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hs6st1Q9QYK5 411 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mbtps1Q9WTZ2 1052 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mad2l1Q9Z1B5 205 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mroh7A2AVR2 1279 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cylc2B1AWN8 422 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp780bE9Q2S6 806 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm14496K7N5U4 849 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ppef1O35655 650 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Phox2bO35690 314 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pik3cdO35904 1043 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Psmb10O35955 273 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Btnl2O70355 454 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prf1P10820 554 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 WarsP32921 481 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 ThrbP37242 461 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tnfsf4P43488 198 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ppp3ccP48455 513 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nploc4P60670 608 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Uba1Q02053 1058 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Muc1Q02496 630 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 DtlQ3TLR7 729 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp607aQ3TQG9 686 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 WhammQ571B6 793 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cfap52Q5F201 620 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc25a23Q6GQS1 467 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 RimklaQ6PFX8 380 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prdx6bQ8BG37 224 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ifi44Q8BV66 422 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cars2Q8BYM8 551 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kcnv1Q8BZN2 503 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Piwil2Q8CDG1 971 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccdc17Q8CE13 565 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 BroxQ8K2Q7 411 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sirt3Q8R104 334 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CtbsQ8R242 366 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccdc59Q8R2N0 240 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1361Q8VFH0 317 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pcdhb8Q91XZ2 779 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 March2Q99M02 246 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ergic3Q9CQE7 383 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Atp13a2Q9CTG6 1169 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Snx2Q9CWK8 519 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Spcs2Q9CYN2 226 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 2010109A12RikQ9D875 119 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Alg13Q9D8C3 1166 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 AcadsbQ9DBL1 432 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Wdr12Q9JJA4 423 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Plod2Q9R0B9 737 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CtszQ9WUU7 306 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kif26aQ52KG5 1881 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ighv11-2A0A075B5R8 117 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cylc1A0A1B0GR13 642 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm45713A0A1B0GS68 446 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lcn6A2AJB9 181 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmem45a2B7ZWJ5 289 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lipo4D3Z608 396 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm8267E9Q207 261 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 RfngO09009 332 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Anxa6P14824 673 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ifrd1P19182 449 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Apex1P28352 317 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc11a2P49282 568 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 B3gat3P58158 335 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmc5Q32NZ6 967 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cyp2j13Q3UNV4 503 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1198Q7TR12 308 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nacc1Q7TSZ8 514 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Chil6Q80W26 440 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 C2cd4bQ80XU5 340 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tex13c3Q810P0 219 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Morc4Q8BMD7 928 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Svs2Q8BS30 375 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fastkd3Q8BSN9 661 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lrch3Q8BVU0 778 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 4933409G03RikQ8C5U0 320 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc49a3Q8CE47 516 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lrrc56Q8K375 552 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kctd11Q8K485 232 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Klrb1fQ8VD98 217 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr854Q8VFF1 315 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Aco2Q99KI0 780 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trmt11Q9CWH5 460 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mrpl45Q9D0Q7 306 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tspan11Q9D1D1 253 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hm13Q9D8V0 378 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cdc42ep5Q9Z0X0 150 aa6.54□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Spin2gA0A0N4SW15 236 aa6.53□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm21964A0A1W2P7S4 437 aa6.53□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fam131cA2ADB2 273 aa6.53□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pgbd1E9Q492 415 aa6.53□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Spin2eJ3QNQ0 234 aa6.53□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn2r53L7N473 806 aa6.53□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 36.1 ms