RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637100.1

CLN3-255, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLN3, Length 1,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-255ENST00000637100 MAPK9P45984 424 aa16.16■□□□□ 0.18
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CLN3-255ENST00000637100 SLC25A51Q9H1U9 297 aa16.15■□□□□ 0.18
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CLN3-255ENST00000637100 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
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CLN3-255ENST00000637100 NR1D1P20393 614 aa16.13■□□□□ 0.17
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CLN3-255ENST00000637100 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
CLN3-255ENST00000637100 CYB5D1Q6P9G0 228 aa16.13■□□□□ 0.17
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CLN3-255ENST00000637100 SEC14L1Q92503 715 aa16.13■□□□□ 0.17
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CLN3-255ENST00000637100 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa16.13■□□□□ 0.17
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CLN3-255ENST00000637100 CDK14O94921 469 aa16.12■□□□□ 0.17
CLN3-255ENST00000637100 TIAF1O95411 115 aa16.12■□□□□ 0.17
CLN3-255ENST00000637100 PDGFAP04085 211 aa16.12■□□□□ 0.17
CLN3-255ENST00000637100 CCNYL3P0C7X3 344 aa16.12■□□□□ 0.17
CLN3-255ENST00000637100 FECHP22830 423 aa16.12■□□□□ 0.17
CLN3-255ENST00000637100 HMGCLP35914 325 aa16.12■□□□□ 0.17
CLN3-255ENST00000637100 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
CLN3-255ENST00000637100 CACHD1Q5VU97 1274 aa16.12■□□□□ 0.17
CLN3-255ENST00000637100 NT5DC3Q86UY8 548 aa16.12■□□□□ 0.17
CLN3-255ENST00000637100 PPP1R3BQ86XI6 285 aa16.12■□□□□ 0.17
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