RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	MTA1	Q13330	715 aa		12.96	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	USP41	Q3LFD5	358 aa		12.96	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		12.96	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	12.96	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		12.96	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		12.96	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	FNDC5	Q8NAU1	212 aa		12.96	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		12.96	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		12.96	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152		A0A1B0GVG6	124 aa		12.96	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	DHRS12	A0PJE2	317 aa		12.96	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	GUCA1C	O95843	209 aa		12.96	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	GK	P32189	559 aa		12.96	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	BFSP2	Q13515	415 aa		12.96	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		12.96	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		12.96	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		12.96	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	AHI1	Q8N157	1196 aa		12.96	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		12.96	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		12.96	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	PLD4	Q96BZ4	506 aa		12.96	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		12.96	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	GID8	Q9NWU2	228 aa		12.96	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	MTRR	Q9UBK8	725 aa		12.96	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	USP22	Q9UPT9	525 aa		12.96	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	RNF11	Q9Y3C5	154 aa		12.96	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	PKP3	Q9Y446	797 aa		12.96	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	E2F3	O00716	465 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	PFDN6	O15212	129 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	INPP4B	O15327	924 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	MATN4	O95460	622 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	MT-ND1	P03886	318 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	UROS	P10746	265 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	PRKCQ	Q04759	706 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	KRT80	Q6KB66	452 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	GPRIN3	Q6ZVF9	776 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	WFDC5	Q8TCV5	224 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF597	Q96LX8	424 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	PLK2	Q9NYY3	685 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	ASPDH	A6ND91	283 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	PLOD2	O00469	737 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	MLYCD	O95822	493 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	SEMG2	Q02383	582 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	MFN1	Q8IWA4	741 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	BOC	Q9BWV1	1114 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	VPS9D1	Q9Y2B5	631 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152		A0A1W2PP18	115 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC154	A6NI56	674 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	STX16	O14662	325 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	ARPC2	O15144	300 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	SLC22A3	O75751	556 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	HOXD10	P28358	340 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	CA5A	P35218	305 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	HTR6	P50406	440 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	CYP51A1	Q16850	503 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	AAK1	Q2M2I8	961 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	LRRC43	Q8N309	656 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	CBR4	Q8N4T8	237 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	METTL6	Q8TCB7	284 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	KCNJ9	Q92806	393 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	CIPC	Q9C0C6	399 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	ALG2	Q9H553	416 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	AIG1	Q9NVV5	245 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
BRF1-222	ENST00000635152	CAPN1	P07384	714 aa		12.94	□□□□□ -0.34

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