RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578009.5

IFT20-205, Transcript of intraflagellar transport 20, human

TSL 3

Gene IFT20, Length 611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IFT20-205	ENST00000578009	CPNE1	Q99829	537 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	KIFC1	Q9BW19	673 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	SIK2	Q9H0K1	926 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	CWH43	Q9H720	699 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	VPS45	Q9NRW7	570 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	TBX21	Q9UL17	535 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	PLLP	Q9Y342	182 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	TIMM44	O43615	452 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	B3GALT2	O43825	422 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	SPAG7	O75391	227 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	ATP5H	O75947	161 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	VNN2	O95498	520 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	LATS1	O95835	1130 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	NR4A1	P22736	598 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	PBX3	P40426	434 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	MAGEA12	P43365	314 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	PGF	P49763	221 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	ADAM8	P78325	824 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	DSG1	Q02413	1049 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	CREM	Q03060	361 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	IL10RB	Q08334	325 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	MPP3	Q13368	585 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	RAB33A	Q14088	237 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	PSMD5	Q16401	504 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	UGP2	Q16851	508 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	TCTN1	Q2MV58	587 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	GALNTL6	Q49A17	601 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	FAM209A	Q5JX71	171 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	ATG16L1	Q676U5	607 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	FBXL22	Q6P050	247 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	CASC4	Q6P4E1	433 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	C14orf80	Q86SX3	495 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	MPP5	Q8N3R9	675 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	GDAP1	Q8TB36	358 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	MGARP	Q8TDB4	240 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	PEX13	Q92968	403 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	ATP2A3	Q93084	1043 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	TOP1MT	Q969P6	601 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	TADA1	Q96BN2	335 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	CERS2	Q96G23	380 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	ZNF558	Q96NG5	402 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	AGAP3	Q96P47	875 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	RANBP9	Q96S59	729 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	MAGEH1	Q9H213	219 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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