RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa16.87■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa16.87■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 HGSO14964 777 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 TNFSF15O95150 251 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 CD1CP29017 333 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 UGT1A5P35504 534 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 EPHA4P54764 986 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 RPS6KA1Q15418 735 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 CHRNA6Q15825 494 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 AMZ1Q400G9 498 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 MEI1Q5TIA1 1274 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 CRTC3Q6UUV7 619 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 WASH2PQ6VEQ5 465 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR4D9Q8NGE8 314 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR10G6Q8NH81 332 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC38A3Q99624 504 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 DPH1Q9BZG8 443 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 EPB41L1Q9H4G0 881 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 WASH6PQ9NQA3 447 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARL5AQ9Y689 179 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 BPTFQ12830 3046 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 KLHL33A6NCF5 533 aa16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRR19A6NJB7 356 aa16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 DUX1O43812 170 aa16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 SNX2O60749 519 aa16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 EML2O95834 649 aa16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 JMJD7P0C870 316 aa16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 HADHAP40939 763 aa16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 UCNP55089 124 aa16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 PHF19Q5T6S3 580 aa16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 AGAP9Q5VTM2 703 aa16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 KCTD11Q693B1 232 aa16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 DENND5AQ6IQ26 1287 aa16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 FOXR1Q6PIV2 292 aa16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF547Q8IVP9 402 aa16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRIM58Q8NG06 486 aa16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR4K2Q8NGD2 314 aa16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 APOL2Q9BQE5 337 aa16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM121Q9BTD3 319 aa16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 B3GNT4Q9C0J1 378 aa16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 UCK1Q9HA47 277 aa16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 RDH14Q9HBH5 336 aa16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 BUD23O43709 281 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 LIASO43766 372 aa16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 MTX2O75431 263 aa16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRAMEF1O95521 474 aa16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 IDSP22304 550 aa16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 LIMK2P53671 638 aa16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 DMPKQ09013 629 aa16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCDC173Q0VFZ6 552 aa16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 OASLQ15646 514 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 GPRC6AQ5T6X5 926 aa16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 BROXQ5VW32 411 aa16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 LINC00523Q86TU6 105 aa16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF398Q8TD17 642 aa16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 KCNE4Q8WWG9 221 aa16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 NUDT22Q9BRQ3 303 aa16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 SEMA6CQ9H3T2 930 aa16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 LZTFL1Q9NQ48 299 aa16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 CPNE7Q9UBL6 633 aa16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC23A2Q9UGH3 650 aa16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 ACSL6Q9UKU0 697 aa16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 LOXL2Q9Y4K0 774 aa16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 KIF26BQ2KJY2 2108 aa16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa16.83■□□□□ 0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 LILRA5A6NI73 299 aa16.83■□□□□ 0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 NVLO15381 856 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 UGT1A9O60656 530 aa16.83■□□□□ 0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 SRP72O76094 671 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 METTL18O95568 372 aa16.83■□□□□ 0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 AP2A1O95782 977 aa16.83■□□□□ 0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 UGT1A6P19224 532 aa16.83■□□□□ 0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 UGT1A1P22309 533 aa16.83■□□□□ 0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 UGT1A4P22310 534 aa16.83■□□□□ 0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 UGT1A3P35503 534 aa16.83■□□□□ 0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 GDF10P55107 478 aa16.83■□□□□ 0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.6 ms