RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565821.1

CYCSP39-201, Transcript of cytochrome c, somatic pseudogene 39, humanhuman

BASIC

Gene CYCSP39, Length 309 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYCSP39-201ENST00000565821 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
CYCSP39-201ENST00000565821 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa3.13□□□□□ -1.91
CYCSP39-201ENST00000565821 MYO10Q9HD67 2058 aa3.13□□□□□ -1.91
CYCSP39-201ENST00000565821 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa3.12□□□□□ -1.91
CYCSP39-201ENST00000565821 C2orf16Q68DN1 1984 aa3.12□□□□□ -1.91
CYCSP39-201ENST00000565821 ZNF318Q5VUA4 2279 aa3.12□□□□□ -1.91
CYCSP39-201ENST00000565821 A0A1W2PPH5 198 aa3.12□□□□□ -1.91
CYCSP39-201ENST00000565821 TTC26A0AVF1 554 aa3.12□□□□□ -1.91
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CYCSP39-201ENST00000565821 NPIPB4C9JG80 1138 aa3.12□□□□□ -1.91
CYCSP39-201ENST00000565821 H3BQV1 296 aa3.12□□□□□ -1.91
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CYCSP39-201ENST00000565821 DSCR3O14972 297 aa3.12□□□□□ -1.91
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CYCSP39-201ENST00000565821 TGFB1I1O43294 461 aa3.12□□□□□ -1.91
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CYCSP39-201ENST00000565821 ADRB2P07550 413 aa3.12□□□□□ -1.91
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CYCSP39-201ENST00000565821 RXRGP48443 463 aa3.12□□□□□ -1.91
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CYCSP39-201ENST00000565821 CASP4P49662 377 aa3.12□□□□□ -1.91
CYCSP39-201ENST00000565821 PGFP49763 221 aa3.12□□□□□ -1.91
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CYCSP39-201ENST00000565821 CACNA2D1P54289 1103 aa3.12□□□□□ -1.91
CYCSP39-201ENST00000565821 CDH15P55291 814 aa3.12□□□□□ -1.91
CYCSP39-201ENST00000565821 B4GALNT1Q00973 533 aa3.12□□□□□ -1.91
CYCSP39-201ENST00000565821 SLC14A1Q13336 389 aa3.12□□□□□ -1.91
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CYCSP39-201ENST00000565821 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP3.12□□□□□ -1.91
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CYCSP39-201ENST00000565821 SLC39A14Q15043 492 aa3.12□□□□□ -1.91
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CYCSP39-201ENST00000565821 RNF144BQ7Z419 303 aa3.12□□□□□ -1.91
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CYCSP39-201ENST00000565821 BRSK2Q8IWQ3 736 aa3.12□□□□□ -1.91
CYCSP39-201ENST00000565821 ZNF366Q8N895 744 aa3.12□□□□□ -1.91
CYCSP39-201ENST00000565821 TMEM105Q8N8V8 129 aa3.12□□□□□ -1.91
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CYCSP39-201ENST00000565821 PRSS33Q8NF86 280 aa3.12□□□□□ -1.91
CYCSP39-201ENST00000565821 OR5B17Q8NGF7 314 aa3.12□□□□□ -1.91
CYCSP39-201ENST00000565821 OR10T2Q8NGX3 314 aa3.12□□□□□ -1.91
CYCSP39-201ENST00000565821 RFWD2Q8NHY2 731 aa3.12□□□□□ -1.91
CYCSP39-201ENST00000565821 ING5Q8WYH8 240 aa3.12□□□□□ -1.91
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CYCSP39-201ENST00000565821 EEF2KMTQ96G04 330 aa3.12□□□□□ -1.91
CYCSP39-201ENST00000565821 P2RY11Q96G91 374 aa3.12□□□□□ -1.91
CYCSP39-201ENST00000565821 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
CYCSP39-201ENST00000565821 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
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CYCSP39-201ENST00000565821 C7orf26Q96N11 449 aa3.12□□□□□ -1.91
CYCSP39-201ENST00000565821 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
CYCSP39-201ENST00000565821 CBWD1Q9BRT8 395 aa3.12□□□□□ -1.91
CYCSP39-201ENST00000565821 ZNF747Q9BV97 191 aa3.12□□□□□ -1.91
CYCSP39-201ENST00000565821 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
CYCSP39-201ENST00000565821 NFKBIZQ9BYH8 718 aa3.12□□□□□ -1.91
CYCSP39-201ENST00000565821 TOR3AQ9H497 397 aa3.12□□□□□ -1.91
CYCSP39-201ENST00000565821 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa3.12□□□□□ -1.91
CYCSP39-201ENST00000565821 IL21RQ9HBE5 538 aa3.12□□□□□ -1.91
CYCSP39-201ENST00000565821 ASB6Q9NWX5 421 aa3.12□□□□□ -1.91
CYCSP39-201ENST00000565821 ARL15Q9NXU5 204 aa3.12□□□□□ -1.91
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