RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530513.5

PACSIN3-207, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-207ENST00000530513 TMC3Q7Z5M5 1100 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 LRRTM4Q86VH4 590 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 ZNF547Q8IVP9 402 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 RSC1A1Q92681 617 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 IQCDQ96DY2 449 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 ABHD17AQ96GS6 310 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 AGAP3Q96P47 875 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 ANAPC2Q9UJX6 822 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 H2AFZP0C0S5 128 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 BPIP17213 487 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 MC1RQ01726 317 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 IGFBP7Q16270 282 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 PDPK2PQ6A1A2 396 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 SLC9A4Q6AI14 798 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 NPNTQ6UXI9 565 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 H2AFVQ71UI9 128 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 TADA1Q96BN2 335 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 OLFM3Q96PB7 478 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 OR6C1Q96RD1 312 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 TIMM29Q9BSF4 260 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 GPR63Q9BZJ6 419 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 MAGEE1Q9HCI5 957 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 CROTQ9UKG9 612 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 SPO11Q9Y5K1 396 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 OR52A4PA6NMU1 304 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 KMOO15229 486 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 RPL10P27635 214 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 DLSTP36957 453 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 CAPZBP47756 277 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 MESDQ14696 234 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 SLC18A3Q16572 532 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 NT5DC3Q86UY8 548 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 GALNT6Q8NCL4 622 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 SPATA22Q8NHS9 363 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 RAD18Q9NS91 495 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 POT1Q9NUX5 634 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 ZNF487B1APH4 448 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 AURKAO14965 403 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 RASSF9O75901 435 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 AMD1P17707 334 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 NR1D1P20393 614 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 NOP2P46087 812 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 DRG2P55039 364 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 CDK18Q07002 472 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 GPR18Q14330 331 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 ELMO2Q96JJ3 720 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 SLC25A51Q9H1U9 297 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 LCMT1Q9UIC8 334 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 KCNMB2Q9Y691 235 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 APOL1O14791 398 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 KIAA0754O94854 1291 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 FURINP09958 794 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 PDK1Q15118 436 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 PRSS42Q7Z5A4 293 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 C11orf96Q7Z7L8 435 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 BPIFA1Q9NP55 256 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 SLC40A1Q9NP59 571 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 TRIM10Q9UDY6 481 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 KCTD3Q9Y597 815 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 VEGFDO43915 354 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 CDK14O94921 469 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 NDUFA10O95299 355 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 KRT1P04264 644 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 TMEM253P0C7T8 217 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 PPP1CAP62136 330 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 DYNLT1P63172 113 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 NOMO1Q15155 1222 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 SLC14A2Q15849 920 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 FAM92BQ6ZTR7 304 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 RASGRP3Q8IV61 690 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 VPS35Q96QK1 796 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 UBP1Q9NZI7 540 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 ANKMY1Q9P2S6 941 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 WDR37Q9Y2I8 494 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-207ENST00000530513 K7EM74 188 aa21.95■■□□□ 1.1
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