RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-222ENST00000514552 GON4LQ3T8J9 2241 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 PCNX2A6NKB5 2137 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 CKAP5Q14008 2032 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 A0A087WWL8 130 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 MYO1CO00159 1063 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 TIMM44O43615 452 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 TRIAP1O43715 76 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 CER1O95813 267 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 CHRM3P20309 590 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 ADORA2BP29275 332 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 MXI1P50539 228 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 WNT3P56703 355 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 ZBTB16Q05516 673 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 SLC13A2Q13183 592 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 TUBB3Q13509 450 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 RAB32Q13637 225 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 IQCB1Q15051 598 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 CNGA2Q16280 664 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 FUT11Q495W5 492 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 ZCWPW2Q504Y3 356 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 PM20D1Q6GTS8 502 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 SPOPLQ6IQ16 392 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 Q6YL49 198 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 TPGS1Q6ZTW0 290 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 SCD5Q86SK9 330 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 NAXDQ8IW45 347 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 FAM186BQ8IYM0 893 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP7□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 ANKRD52Q8NB46 1076 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 FBXL13Q8NEE6 735 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 LINC00476Q8WZB0 136 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 SLC46A1Q96NT5 459 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 ACOX2Q99424 681 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 SMURF2Q9HAU4 748 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 CASS4Q9NQ75 786 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 ITM2CQ9NQX7 267 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 STON1Q9Y6Q2 735 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 MYOFQ9NZM1 2061 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 APC2O95996 2303 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 ACACAQ13085 2346 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 GRID2IPA4D2P6 1211 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 MEI4A8MW99 385 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 F5H697 171 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 PROM1O43490 865 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 CBFA2T3O75081 653 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 KLKB1P03952 638 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 TRIM49P0CI25 452 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 TRIM49CP0CI26 452 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 BRAFP15056 766 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 CD58P19256 250 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 SYKP43405 635 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 GCLMP48507 274 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 TPMTP51580 245 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 COPAP53621 1224 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 BCAT1P54687 386 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 TBX4P57082 545 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 GRIK2Q13002 908 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 CTBP1Q13363 440 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 MPPE1Q53F39 396 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 COBLL1Q53SF7 1204 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 MPP7Q5T2T1 576 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 KRT78Q8N1N4 520 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 SLC4A11Q8NBS3 891 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 SLC16A11Q8NCK7 471 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 Q96MF0 132 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 BTBD1Q9H0C5 482 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 NUP62CLQ9H1M0 184 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 CISHQ9NSE2 258 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 ELOVL2Q9NXB9 296 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 KCTD5Q9NXV2 234 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-222ENST00000514552 CPNE7Q9UBL6 633 aa6.99□□□□□ -1.29
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