RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC5A2	P31639	672 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	CETN2	P41208	172 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARSD	P51689	593 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	LIMK2	P53671	638 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	GSDMD	P57764	484 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	HHEX	Q03014	270 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	CLN3	Q13286	438 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPARCL1	Q14515	664 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	DDHD1	Q8NEL9	900 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	PMEPA1	Q969W9	287 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	TIMM29	Q9BSF4	260 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	SMOX	Q9NWM0	555 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	PISD	Q9UG56	409 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	12.52	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	KALRN	O60229	2985 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A0G2JNG1	304 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	GLYATL1P3	A0A0U1RQE8	302 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	AGAP14	A8MT82	685 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	C9orf172	C9J069	976 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	KMO	O15229	486 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARHGAP6	O43182	974 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	SGTA	O43765	313 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	PPFIA2	O75334	1257 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCL4	P13236	92 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	MPST	P25325	297 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC19A1	P41440	591 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	GPLD1	P80108	840 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCZ1B	P86790	482 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	NFATC2	Q13469	925 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	KIR2DS5	Q14953	304 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	PHF19	Q5T6S3	580 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	TTC13	Q8NBP0	860 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR13C4	Q8NGS5	318 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	NAT14	Q8WUY8	206 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	RTP4	Q96DX8	246 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	DPH1	Q9BZG8	443 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	OGFR	Q9NZT2	677 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	SDK2	Q58EX2	2172 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR5K4	A6NMS3	321 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	NVL	O15381	856 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	KLK10	O43240	276 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	EFS	O43281	561 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	LDB2	O43679	373 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRAMEF10	O60809	474 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRAMEF1	O95521	474 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	DMPK	Q09013	629 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRPSAP1	Q14558	356 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	CLCA4	Q14CN2	919 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	INSC	Q1MX18	579 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	PARP6	Q2NL67	630 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	PCSK4	Q6UW60	755 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF398	Q8TD17	642 aa		12.5	□□□□□ -0.41

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