RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 CXorf40BQ96DE9 158 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP2-220ENST00000511663 C9orf72Q96LT7 481 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP2-220ENST00000511663 TIMM29Q9BSF4 260 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP2-220ENST00000511663 SPRY4Q9C004 299 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP2-220ENST00000511663 APMAPQ9HDC9 416 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
SH3BP2-220ENST00000511663 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP2-220ENST00000511663 ADGRG1Q9Y653 693 aa18.98■□□□□ 0.63
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SH3BP2-220ENST00000511663 NKX2-8O15522 239 aa18.97■□□□□ 0.63
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SH3BP2-220ENST00000511663 RASSF9O75901 435 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP2-220ENST00000511663 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
SH3BP2-220ENST00000511663 PRKAR1AP10644 381 aa18.97■□□□□ 0.63
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SH3BP2-220ENST00000511663 TCN2P20062 427 aa18.97■□□□□ 0.63
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SH3BP2-220ENST00000511663 POT1Q9NUX5 634 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP2-220ENST00000511663 UBP1Q9NZI7 540 aa18.97■□□□□ 0.63
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SH3BP2-220ENST00000511663 ARHGAP6O43182 974 aa18.96■□□□□ 0.63
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SH3BP2-220ENST00000511663 MTX2O75431 263 aa18.96■□□□□ 0.63
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SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
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SH3BP2-220ENST00000511663 C16orf46Q6P387 395 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2-220ENST00000511663 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa18.96■□□□□ 0.63
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SH3BP2-220ENST00000511663 SPTLC3Q9NUV7 552 aa18.96■□□□□ 0.63
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SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
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SH3BP2-220ENST00000511663 IL11RAQ14626 422 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM182AQ5T1J6 154 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP2-220ENST00000511663 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
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SH3BP2-220ENST00000511663 STARD8Q92502 1023 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP2-220ENST00000511663 P3H4Q92791 437 aa18.95■□□□□ 0.62
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SH3BP2-220ENST00000511663 TRIM10Q9UDY6 481 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP2-220ENST00000511663 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa18.95■□□□□ 0.62
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SH3BP2-220ENST00000511663 EPOP01588 193 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2-220ENST00000511663 CCNYL3P0C7X3 344 aa18.94■□□□□ 0.62
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SH3BP2-220ENST00000511663 PPP2R5EQ16537 467 aa18.94■□□□□ 0.62
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SH3BP2-220ENST00000511663 AGAP9Q5VTM2 703 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2-220ENST00000511663 CACHD1Q5VU97 1274 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2-220ENST00000511663 KAZNQ674X7 775 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2-220ENST00000511663 MFSD7Q6UXD7 560 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2-220ENST00000511663 PID1Q7Z2X4 250 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2-220ENST00000511663 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2-220ENST00000511663 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC40A1Q9NP59 571 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2-220ENST00000511663 HACD3Q9P035 362 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2-220ENST00000511663 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2-220ENST00000511663 INTUQ9ULD6 942 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2-220ENST00000511663 AURKAO14965 403 aa18.93■□□□□ 0.62
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