RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511129.2

SCARB2-205, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

TSL 2

Gene SCARB2, Length 860 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-205ENST00000511129 KHKP50053 298 aa5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 CCT8P50990 548 aa5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 MAP3K7CLP57077 242 aa5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 RIPK4P57078 832 aa5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 TEFQ10587 303 aa5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 IL24Q13007 206 aa5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 GPS1Q13098 491 aa5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 ZSCAN26Q16670 478 aa5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 HADHQ16836 314 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 HFEQ30201 348 aa5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 LRIT3Q3SXY7 679 aa5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 NHSL2Q5HYW2 709 aa5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 AKNAD1Q5T1N1 836 aa5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 STXBP5Q5T5C0 1151 aa5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 TTC22Q5TAA0 569 aa5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 ANKRD16Q6P6B7 361 aa5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 SUSD1Q6UWL2 747 aa5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 OLFML1Q6UWY5 402 aa5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 KIAA0408Q6ZU52 694 aa5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 USP49Q70CQ1 688 aa5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 MIER3Q7Z3K6 550 aa5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 CEP57Q86XR8 500 aa5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 DENND6AQ8IWF6 608 aa5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 SYCP3Q8IZU3 236 aa5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 WDTC1Q8N5D0 677 aa5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 SIRT6Q8N6T7 355 aa5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 C11orf44Q8N8P7 122 aa5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 ATAD1Q8NBU5 361 aa5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 OR1N1Q8NGS0 311 aa5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 OR13C2Q8NGS9 318 aa5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 SCAMP5Q8TAC9 235 aa5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 GANCQ8TET4 914 aa5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 CORO2AQ92828 525 aa5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 SLC22A18Q96BI1 424 aa5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 APOPT1Q96IL0 206 aa5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 NLRP4Q96MN2 994 aa5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 TCEANC2Q96MN5 208 aa5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 CATSPER2Q96P56 530 aa5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 RAD9AQ99638 391 aa5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 DUSP26Q9BV47 211 aa5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 MTMR12Q9C0I1 747 aa5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 GLT8D2Q9H1C3 349 aa5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 PCED1AQ9H1Q7 454 aa5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 SCPEP1Q9HB40 452 aa5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 GPR108Q9NPR9 543 aa5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 TRIM36Q9NQ86 728 aa5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 FOXJ2Q9P0K8 574 aa5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 MALT1Q9UDY8 824 aa5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 TUBE1Q9UJT0 475 aa5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 HSF4Q9ULV5 492 aa5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 TNFSF13BQ9Y275 285 aa5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 SNX9Q9Y5X1 595 aa5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 ATP10DQ9P241 1426 aa5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa5.04□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 SCN9AQ15858 1988 aa5.04□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 LIPT2A6NK58 231 aa5.04□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 CES2O00748 559 aa5.04□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 CYTIPO60759 359 aa5.04□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 DIAPH2O60879 1101 aa5.04□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 SLPIP03973 132 aa5.04□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 FGF4P08620 206 aa5.04□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 VIMP08670 466 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 NPSP0C0P6 89 aa5.04□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 FDPSP14324 419 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 CREB1P16220 341 aa5.04□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 ENGP17813 658 aa5.04□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 PRKACBP22694 351 aa5.04□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 CPT2P23786 658 aa5.04□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 MSNP26038 577 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 PTPN3P26045 913 aa5.04□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 CCR1P32246 355 aa5.04□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 LONP1P36776 959 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 PAFAH1B1P43034 410 aa5.04□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 NPY4RP50391 375 aa5.04□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 BMXP51813 675 aa5.04□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 PRELPP51888 382 aa5.04□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 HMGA2P52926 109 aa5.04□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 STX1BP61266 288 aa5.04□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 PRKCEQ02156 737 aa5.04□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 DPYSQ14117 519 aa5.04□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 RCN2Q14257 317 aa5.04□□□□□ -1.6
SCARB2-205ENST00000511129 SQLEQ14534 574 aa5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms