RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509870.1

HOXC-AS3-201, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 544 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RCBTB1Q8NDN9 531 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GDAP1Q8TB36 358 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ACTL9Q8TC94 416 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LACRTQ9GZZ8 138 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZMYND15Q9H091 742 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GBA3Q9H227 469 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 UCK1Q9HA47 277 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PRDM8Q9NQV8 689 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 B4E171 279 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RBP3P10745 1247 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IDSP22304 550 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SPAM1P38567 509 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TSPAN7P41732 249 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CHRNA4P43681 627 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ITGA9Q13797 1035 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PRPSAP1Q14558 356 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LDLRAP1Q5SW96 308 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 WASH2PQ6VEQ5 465 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KIAA1328Q86T90 577 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DTX1Q86Y01 620 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SYCE1Q8N0S2 351 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LRRC57Q8N9N7 239 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NCSTNQ92542 709 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DDA1Q9BW61 102 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 WASH6PQ9NQA3 447 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 WDR70Q9NW82 654 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FOXJ2Q9P0K8 574 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IMPACTQ9P2X3 320 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC23A2Q9UGH3 650 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FASNP49327 2511 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MACROD2A1Z1Q3 448 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C5orf60A6NFR6 353 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LILRA5A6NI73 299 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PRR19A6NJB7 356 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C2orf81A6NN90 581 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 STMND1H3BQB6 276 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 EFSO43281 561 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MTX2O75431 263 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 VIPP01282 170 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MPSTP25325 297 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RAB15P59190 212 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KIF5AQ12840 1032 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TGIF1Q15583 401 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 AGAP9Q5VTM2 703 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RANBP10Q6VN20 620 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZFAND4Q86XD8 727 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PLXDC1Q8IUK5 500 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF547Q8IVP9 402 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRIM48Q8IWZ4 208 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 UBL4BQ8N7F7 174 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TTC13Q8NBP0 860 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ALG3Q92685 438 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LRRC45Q96CN5 670 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC39A1Q9NY26 324 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TMEM9Q9P0T7 183 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 AMFRQ9UKV5 643 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LOC400499M0QZD8 3231 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GRID2IPA4D2P6 1211 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PDZK1P1A8MUH7 402 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 F5H423 210 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 STX7O15400 261 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 AGTP01019 485 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PYGMP11217 842 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LPOP22079 712 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PDE1BQ01064 536 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CHRNA6Q15825 494 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MANEAQ5SRI9 462 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DCAF12Q5T6F0 453 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PCSK4Q6UW60 755 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TMEM26Q6ZUK4 368 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PEX26Q7Z412 305 aa14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms