RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507692.5

SNHG4-205, Transcript of small nucleolar RNA host gene 4, human

TSL 5

Gene SNHG4, Length 575 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG4-205	ENST00000507692	GPR33	Q49SQ1	333 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	SNX20	Q7Z614	316 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	CCNJL	Q8IV13	435 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	NAGS	Q8N159	534 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	ARL14	Q8N4G2	192 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	PRELID2	Q8N945	189 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	AVL9	Q8NBF6	648 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	DDHD1	Q8NEL9	900 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	OR13C4	Q8NGS5	318 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	STYX	Q8WUJ0	223 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	ULK4	Q96C45	1275 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	NXPE2	Q96DL1	559 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	MS4A14	Q96JA4	679 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	TIMM29	Q9BSF4	260 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	CCDC86	Q9H6F5	360 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	ASB8	Q9H765	288 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	KLC4	Q9NSK0	619 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	NLE1	Q9NVX2	485 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	LRIT1	Q9P2V4	623 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	SNX12	Q9UMY4	172 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	KCNK6	Q9Y257	313 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	KCTD3	Q9Y597	815 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	EML6	Q6ZMW3	1958 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692		A0A0G2JNG1	304 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	HEATR9	A2RTY3	570 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	KLHL33	A6NCF5	533 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	MROH6	A6NGR9	719 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	USP27X	A6NNY8	438 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	AGAP14	A8MT82	685 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692		D6RAR5	112 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	CFAP99	D6REC4	459 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692		H7C0S8	307 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	AP3B1	O00203	1094 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	SNPH	O15079	494 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	GPR39	O43194	453 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	SNX2	O60749	519 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	PHF2	O75151	1096 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	KRT14	P02533	472 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	F3	P13726	295 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	TPSB2	P20231	275 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	IDS	P22304	550 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	ADRA1D	P25100	572 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	ALDH4A1	P30038	563 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	MC4R	P32245	332 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	GNG11	P61952	73 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	CCL7	P80098	99 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	XIAP	P98170	497 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	CDK16	Q00536	496 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	HHEX	Q03014	270 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	CACNG1	Q06432	222 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	KIR2DS5	Q14953	304 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	NR1D2	Q14995	579 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	RTP5	Q14D33	572 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	TPSAB1	Q15661	275 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	CYP1B1	Q16678	543 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	ST3GAL2	Q16842	350 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	ISX	Q2M1V0	245 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	MAP9	Q49MG5	647 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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