RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495022.5

TRDMT1-211, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRDMT1, Length 1,374 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-211ENST00000495022 GFERP55789 205 aa22.22■■□□□ 1.15
TRDMT1-211ENST00000495022 PCSK7Q16549 785 aa22.22■■□□□ 1.15
TRDMT1-211ENST00000495022 KDELC2Q7Z4H8 507 aa22.22■■□□□ 1.15
TRDMT1-211ENST00000495022 TRIM48Q8IWZ4 208 aa22.22■■□□□ 1.15
TRDMT1-211ENST00000495022 ESX1Q8N693 406 aa22.22■■□□□ 1.15
TRDMT1-211ENST00000495022 NDST3O95803 873 aa22.21■■□□□ 1.15
TRDMT1-211ENST00000495022 SLC4A1P02730 911 aa22.21■■□□□ 1.15
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TRDMT1-211ENST00000495022 BPIP17213 487 aa22.21■■□□□ 1.15
TRDMT1-211ENST00000495022 SLC19A1P41440 591 aa22.21■■□□□ 1.15
TRDMT1-211ENST00000495022 TLE1Q04724 770 aa22.21■■□□□ 1.15
TRDMT1-211ENST00000495022 LRRC38Q5VT99 294 aa22.21■■□□□ 1.15
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TRDMT1-211ENST00000495022 OR8K1Q8NGG5 319 aa22.21■■□□□ 1.15
TRDMT1-211ENST00000495022 STARD8Q92502 1023 aa22.21■■□□□ 1.15
TRDMT1-211ENST00000495022 VPS35Q96QK1 796 aa22.21■■□□□ 1.15
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TRDMT1-211ENST00000495022 POT1Q9NUX5 634 aa22.21■■□□□ 1.15
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
TRDMT1-211ENST00000495022 TRIM14Q14142 442 aa22.2■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa22.2■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 AGAP9Q5VTM2 703 aa22.2■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 CCDC70Q6NSX1 233 aa22.2■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa22.2■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 NPNTQ6UXI9 565 aa22.2■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 WASH2PQ6VEQ5 465 aa22.2■■□□□ 1.14
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TRDMT1-211ENST00000495022 RHOT2Q8IXI1 618 aa22.2■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 GLOD4Q9HC38 313 aa22.2■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 WASH6PQ9NQA3 447 aa22.2■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa22.2■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 PDZK1P1A8MUH7 402 aa22.19■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 AKR1B10O60218 316 aa22.19■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 CDK14O94921 469 aa22.19■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 KRT1P04264 644 aa22.19■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 TYRP1P17643 537 aa22.19■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 AMD1P17707 334 aa22.19■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 TEX44Q53QW1 395 aa22.19■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM182AQ5T1J6 154 aa22.19■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 RFX6Q8HWS3 928 aa22.19■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF547Q8IVP9 402 aa22.19■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 SPATA22Q8NHS9 363 aa22.19■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 ULBP3Q9BZM4 244 aa22.19■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa22.19■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa22.19■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 BRAFP15056 766 aa22.18■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 TCN2P20062 427 aa22.18■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 OAS2P29728 719 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
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TRDMT1-211ENST00000495022 FOXM1Q08050 763 aa22.18■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 IL11RAQ14626 422 aa22.18■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 ODF2Q5BJF6 829 aa22.18■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 PRSS42Q7Z5A4 293 aa22.18■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 TGM7Q96PF1 710 aa22.18■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 SLC40A1Q9NP59 571 aa22.18■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 ANAPC2Q9UJX6 822 aa22.18■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 MTX2O75431 263 aa22.17■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 VCLP18206 1134 aa22.17■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 IDSP22304 550 aa22.17■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 HMGCLP35914 325 aa22.17■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 NR2C2P49116 596 aa22.17■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 C11orf96Q7Z7L8 435 aa22.17■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 TEKT5Q96M29 485 aa22.17■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 EPN3Q9H201 632 aa22.17■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 TRABDQ9H4I3 376 aa22.17■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa22.17■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 SPO11Q9Y5K1 396 aa22.17■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 AURKAO14965 403 aa22.16■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 PMPCBO75439 489 aa22.16■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 PTPN3P26045 913 aa22.16■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 RPL10P27635 214 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 CASRP41180 1078 aa22.16■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 SLC1A1P43005 524 aa22.16■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 DYNLT1P63172 113 aa22.16■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 DEFB109BQ30KR1 87 aa22.16■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa22.16■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 RHOT1Q8IXI2 618 aa22.16■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 DTX3LQ8TDB6 740 aa22.16■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 BRSK1Q8TDC3 778 aa22.16■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 CXorf40BQ96DE9 158 aa22.16■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 OR6C1Q96RD1 312 aa22.16■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.16■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 RAB33BQ9H082 229 aa22.16■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 EPHA6Q9UF33 1036 aa22.16■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 SEC16AO15027 2179 aa22.16■■□□□ 1.14
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