RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493945.5

ACTB-213, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,236 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-213ENST00000493945 ORAI3Q9BRQ5 295 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 OR2AG1Q9H205 316 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 FAM96AQ9H5X1 160 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 EBF2Q9HAK2 575 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 SLC6A14Q9UN76 642 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 GON4LQ3T8J9 2241 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 A0A1W2PR77 199 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 PRSS38A1L453 326 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 GOLGA8KD6RF30 607 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 H0Y8X5 98 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 GOLGA8TH3BQL2 631 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 NUAK1O60285 661 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 LRP3O75074 770 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 KRT38O76015 456 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 LMNAP02545 664 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 CTSEP14091 401 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 NBL1P41271 181 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 NXPH1P58417 271 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP14.74□□□□□ -0.052e-7■□□□□ 8.8
ACTB-213ENST00000493945 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP14.74□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 TTLL9Q3SXZ7 439 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 TRIM61Q5EBN2 209 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 GRTP1Q5TC63 336 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 SLC23A3Q6PIS1 610 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 STRA8Q7Z7C7 330 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 TSPAN17Q96FV3 270 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 OR2M4Q96R27 311 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 TXLNGYQ9BZA5 131 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 ACBD3Q9H3P7 528 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 GPR27Q9NS67 375 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 CA5BQ9Y2D0 317 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 CACNA1EQ15878 2313 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 GRID2O43424 1007 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 VPS26AO75436 327 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 KRT37O76014 449 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 HSD17B3P37058 310 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 POLD2P49005 469 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 PRLHRP49683 370 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 SRP54P61011 504 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 CTBP1Q13363 440 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 SLC29A2Q14542 456 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 ELOCQ15369 112 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 LPAL2Q16609 132 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 INSCQ1MX18 579 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 INAVAQ3KP66 663 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 BCL7AQ4VC05 210 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 SYTL3Q4VX76 610 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 FAM45BPQ6NSW5 357 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 PIANPQ8IYJ0 282 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 C1orf216Q8TAB5 229 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 FAM45AQ8TCE6 357 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 LPGAT1Q92604 370 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 GSDMCQ9BYG8 508 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 RHOJQ9H4E5 214 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 DNAJC28Q9NX36 388 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 SPASTQ9UBP0 616 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 SLC24A2Q9UI40 661 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 DGKBQ9Y6T7 804 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 SDK1Q7Z5N4 2213 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 A0A1B0GVT2 93 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 GOLGA6L10A6NI86 522 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 NUDT17P0C025 328 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 PKMP14618 531 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 SLC2A4P14672 509 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 GNPDA1P46926 289 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 TMEM220Q6QAJ8 160 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 CCDC91Q7Z6B0 441 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 TRIM74Q86UV6 250 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 HID1Q8IV36 788 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 DENND6AQ8IWF6 608 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 PHACTR4Q8IZ21 702 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 GPATCH11Q8N954 259 aa14.72□□□□□ -0.05
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