RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493653.1

PDS5B-208, Transcript of PDS5 cohesin associated factor B, human

TSL 1 (best)

Gene PDS5B, Length 972 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDS5B-208	ENST00000493653	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	VSTM4	Q8IW00	320 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	BMPER	Q8N8U9	685 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	NCSTN	Q92542	709 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	NKD1	Q969G9	470 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	GLYATL1	Q969I3	302 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	CHP1	Q99653	195 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	CTRC	Q99895	268 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	TRIM4	Q9C037	500 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	KLC4	Q9NSK0	619 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	UBP1	Q9NZI7	540 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	LILRA5	A6NI73	299 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	PMPCB	O75439	489 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	PTPN3	P26045	913 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	GFER	P55789	205 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	NOMO1	Q15155	1222 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	LLGL1	Q15334	1064 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	LRRC38	Q5VT99	294 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	AVL9	Q8NBF6	648 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	RNF214	Q8ND24	703 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	RTP4	Q96DX8	246 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	GLOD4	Q9HC38	313 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	RAD18	Q9NS91	495 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	PDP2	Q9P2J9	529 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	OR5K4	A6NMS3	321 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	SMAP	O00193	183 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	AURKA	O14965	403 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	PSTPIP1	O43586	416 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	NDST3	O95803	873 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	GPR89B	P0CG08	455 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	BPI	P17213	487 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	NFKB1	P19838	968 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	COMT	P21964	271 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	SLC1A1	P43005	524 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	CLCA4	Q14CN2	919 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	SLC14A2	Q15849	920 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	KAZN	Q674X7	775 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	GDAP1	Q8TB36	358 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	TADA1	Q96BN2	335 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	HAUS1	Q96CS2	278 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	RNF31	Q96EP0	1072 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	TIMM29	Q9BSF4	260 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	TSPY26P	Q9H489	355 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	APMAP	Q9HDC9	416 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	CHUK	O15111	745 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	KMO	O15229	486 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	GPR39	O43194	453 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	CST8	O60676	142 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	PPFIA2	O75334	1257 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	VIP	P01282	170 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	PRKAR1A	P10644	381 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	TYRP1	P17643	537 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PDS5B-208	ENST00000493653	CDKN2B	P42772	138 aa		11.61	□□□□□ -0.55

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