RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491569.5

ATP6AP1-209, Transcript of ATPase H+ transporting accessory protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene ATP6AP1, Length 2,079 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1-209ENST00000491569 AGBL4Q5VU57 503 aa20.34■□□□□ 0.85
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ATP6AP1-209ENST00000491569 BTN3A1O00481 513 aa20.31■□□□□ 0.84
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ATP6AP1-209ENST00000491569 SORT1Q99523 831 aa20.31■□□□□ 0.84
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ATP6AP1-209ENST00000491569 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
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ATP6AP1-209ENST00000491569 DTX3LQ8TDB6 740 aa20.3■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 KCNV2Q8TDN2 545 aa20.3■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 KIAA1191Q96A73 305 aa20.3■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 PRR23AA6NEV1 266 aa20.3■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 OR2AG2A6NM03 316 aa20.3■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 CHRNGP07510 517 aa20.3■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.841e-7■■□□□ 14
ATP6AP1-209ENST00000491569 MSH3P20585 1137 aa20.3■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 CCINQ13939 588 aa20.3■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 ACSBG2Q5FVE4 666 aa20.3■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 SEL1L3Q68CR1 1132 aa20.3■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 RAET1GQ6H3X3 334 aa20.3■□□□□ 0.84
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