RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490653.1

PRPF4B-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 4B, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF4B, Length 581 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4B-208ENST00000490653 PMPCBO75439 489 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 CCL4P13236 92 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 GLB1P16278 677 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 PTPN3P26045 913 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 TEAD1P28347 426 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 CD1CP29017 333 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 ALDH4A1P30038 563 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC5A2P31639 672 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 ACTR1BP42025 376 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 CDKN2BP42772 138 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF75DP51815 510 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 INHBCP55103 352 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 ACTR1AP61163 376 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 RAC1P63000 192 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 OLIG2Q13516 323 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 PTPRCAPQ14761 206 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 C16orf72Q14CZ0 275 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 TEX44Q53QW1 395 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 ARHGAP40Q5TG30 622 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 ALS2CLQ60I27 953 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 SARM1Q6SZW1 724 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 RAD9BQ6WBX8 426 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 RAB11FIP2Q7L804 512 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 GPR155Q7Z3F1 870 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 TMC3Q7Z5M5 1100 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 SPRED1Q7Z699 444 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 NT5DC3Q86UY8 548 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 ZFAND4Q86XD8 727 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 SLITRK4Q8IW52 837 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 RHOT2Q8IXI1 618 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 RHOT1Q8IXI2 618 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 NRSN1Q8IZ57 195 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 RCBTB1Q8NDN9 531 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF248Q8NDW4 579 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 PMEPA1Q969W9 287 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 RNF31Q96EP0 1072 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 OR2M4Q96R27 311 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 LYSMD1Q96S90 227 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 FAM118BQ9BPY3 351 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 NUDT22Q9BRQ3 303 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 HEMGNQ9BXL5 484 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 FAM83DQ9H4H8 585 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 BPIFA1Q9NP55 256 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC23A2Q9UGH3 650 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 KCNK6Q9Y257 313 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 SCN8AQ9UQD0 1980 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 BSNQ9UPA5 3926 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa7.24□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa7.24□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 PLD2O14939 933 aa7.24□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 BUD23O43709 281 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 SPOPO43791 374 aa7.24□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 UGT1A9O60656 530 aa7.24□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 MTX2O75431 263 aa7.24□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 TCEA3O75764 348 aa7.24□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 LCA5LO95447 670 aa7.24□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC4A1P02730 911 aa7.24□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 TPM1P09493 284 aa7.24□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF30P17039 623 aa7.24□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 BPIP17213 487 aa7.24□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 UGT1A6P19224 532 aa7.24□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 WT1P19544 449 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 NFKB1P19838 968 aa7.24□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 UGT1A1P22309 533 aa7.24□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 UGT1A4P22310 534 aa7.24□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 CES1P23141 567 aa7.24□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 UGT1A3P35503 534 aa7.24□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 ARSDP51689 593 aa7.24□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 MAPK10P53779 464 aa7.24□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 ERVPABLB-1P60509 514 aa7.24□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 CDK18Q07002 472 aa7.24□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 PDK1Q15118 436 aa7.24□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 LRRC38Q5VT99 294 aa7.24□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa7.24□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 KDELC1Q6UW63 502 aa7.24□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF765Q7L2R6 523 aa7.24□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa7.24□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 LURAP1LQ8IV03 231 aa7.24□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 CNGA4Q8IV77 575 aa7.24□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 LSMEM2Q8N112 164 aa7.24□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 NDUFAF2Q8N183 169 aa7.24□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF567Q8N184 647 aa7.24□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC25A41Q8N5S1 370 aa7.24□□□□□ -1.25
PRPF4B-208ENST00000490653 ACRBPQ8NEB7 543 aa7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms