RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 LAYNQ6UX15 382 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 IFNEQ86WN2 208 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 CILP2Q8IUL8 1156 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 NXPE1Q8N323 547 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 OR10G6Q8NH81 332 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 ECSITQ9BQ95 431 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM30AQ9NV96 361 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 FAM92AA1XBS5 289 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 E2F6O75461 281 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 AP2A2O94973 939 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 ALPPL2P10696 532 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 IL10P22301 178 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 GJA4P35212 333 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 HMGCLP35914 325 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 INPP5AQ14642 412 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 RANBP10Q6VN20 620 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 SCRN2Q96FV2 425 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 CCM2Q9BSQ5 444 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 IL37Q9NZH6 218 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 CCL26Q9Y258 94 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 RGSL1A5PLK6 1076 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 SLC28A1O00337 649 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 BMP10O95393 424 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 AHSGP02765 367 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 ITGB8P26012 769 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 NDUFS1P28331 727 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 OXTRP30559 389 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 ACTR1BP42025 376 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 NME5P56597 212 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 ACTR1AP61163 376 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 TNK2Q07912 1038 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF234Q14588 700 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 GPRC6AQ5T6X5 926 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 ZYG11AQ6WRX3 759 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 PAGE2Q7Z2X7 111 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 UNC5BQ8IZJ1 945 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 MIER2Q8N344 545 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 THTPAQ9BU02 230 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 IL1RL2Q9HB29 575 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 NUMBLQ9Y6R0 609 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 NR5A2O00482 541 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 NIPSNAP2O75323 286 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 HLA-FP30511 346 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 GNPDA1P46926 289 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 CDH13P55290 713 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 DAB2P98082 770 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 NFATC2Q13469 925 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 SLC14A2Q15849 920 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 PGS1Q32NB8 556 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM135Q86UB9 458 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 TRAM1L1Q8N609 369 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 DCAKDQ8WVC6 231 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 SH3BP4Q9P0V3 963 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 RASSF9O75901 435 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 CBSLP0DN79 551 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 HGFP14210 728 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 CALB2P22676 271 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 CBSP35520 551 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 SLC26A3P40879 764 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 CSNK1DP48730 415 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 PRIM2P49643 509 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 AP2B1P63010 937 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 NAE1Q13564 534 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 TSNQ15631 228 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 CYS1Q717R9 158 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 TRIML2Q8N7C3 387 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 AVL9Q8NBF6 648 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 TLCD1Q96CP7 247 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 MSANTD3Q96H12 275 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 ASB16Q96NS5 453 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 CATSPER2Q96P56 530 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 GPR22Q99680 433 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 AIF1LQ9BQI0 150 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 MECRQ9BV79 373 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 ANLNQ9NQW6 1124 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 TAGLN3Q9UI15 199 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 FFAR3O14843 346 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 KMOO15229 486 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 GPR42O15529 346 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF217O75362 1048 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 MTX2O75431 263 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 ANXA6P08133 673 aa8.18□□□□□ -1.1
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