RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484109.1

ABCC4-205, Transcript of ATP binding cassette subfamily C member 4, human

TSL 2

Gene ABCC4, Length 532 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCC4-205	ENST00000484109	TBX18	O95935	607 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCC4-205	ENST00000484109	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ABCC4-205	ENST00000484109	KRT19	P08727	400 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCC4-205	ENST00000484109	DCT	P40126	519 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCC4-205	ENST00000484109	CD81	P60033	236 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCC4-205	ENST00000484109	CCDC6	Q16204	474 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCC4-205	ENST00000484109	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCC4-205	ENST00000484109	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCC4-205	ENST00000484109	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCC4-205	ENST00000484109	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCC4-205	ENST00000484109	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ABCC4-205	ENST00000484109		Q75L30	129 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCC4-205	ENST00000484109	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCC4-205	ENST00000484109	STPG4	Q8N801	248 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCC4-205	ENST00000484109	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCC4-205	ENST00000484109	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ABCC4-205	ENST00000484109	ABHD8	Q96I13	439 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCC4-205	ENST00000484109	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCC4-205	ENST00000484109	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCC4-205	ENST00000484109	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCC4-205	ENST00000484109	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109		J3KRW8	73 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	HIST1H2AB	P04908	130 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	TFAP2A	P05549	437 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	TUBB	P07437	444 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	HIST1H2AD	P20671	130 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	TUBB4B	P68371	445 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	MPP1	Q00013	466 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	LRMP	Q12912	555 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	WDR38	Q5JTN6	314 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	LONP2	Q86WA8	852 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	SLC38A9	Q8NBW4	561 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	UCMA	Q8WVF2	138 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	TM9SF4	Q92544	642 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	WBP2	Q969T9	261 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	C1orf74	Q96LT6	269 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	AASS	Q9UDR5	926 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	MTMR6	Q9Y217	621 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	LIPT2	A6NK58	231 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109		B4E171	279 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	ZBTB43	O43298	467 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	EDIL3	O43854	480 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	PCDH7	O60245	1069 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	WISP2	O76076	250 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	BMP10	O95393	424 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	INHBA	P08476	426 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	RARG	P13631	454 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	MCC	P23508	829 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	HRH2	P25021	359 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	TSPAN7	P41732	249 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	CTSC	P53634	463 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	FBXL22	Q6P050	247 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109		A0A0G2JNG1	304 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109		A0A1W2PPI3	338 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	MAP2K7	O14733	419 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	CIDEA	O60543	219 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	GPC4	O75487	556 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	PDE9A	O76083	593 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	TMEM11	P17152	192 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	NR0B1	P51843	470 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	KIR2DS3	Q14952	304 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	KIR2DS5	Q14953	304 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	ZNF876P	Q49A33	203 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	TECRL	Q5HYJ1	363 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	ANO5	Q75V66	913 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	PXK	Q7Z7A4	578 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	C17orf77	Q96MU5	243 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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