RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483738.1

UBIAD1-203, Transcript of UbiA prenyltransferase domain containing 1, human

TSL 3

Gene UBIAD1, Length 1,393 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBIAD1-203	ENST00000483738	PRL	P01236	227 aa		10.61	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	PIRT	P0C851	137 aa		10.61	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	CASP14	P31944	242 aa		10.61	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	DLST	P36957	453 aa		10.61	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	STAT5A	P42229	794 aa		10.61	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	ARSD	P51689	593 aa		10.61	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	ARSE	P51690	589 aa		10.61	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	PDE1B	Q01064	536 aa		10.61	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	CDK18	Q07002	472 aa		10.61	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	TRIM14	Q14142	442 aa		10.61	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	IL11RA	Q14626	422 aa		10.61	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	IQCB1	Q15051	598 aa		10.61	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	PLCL1	Q15111	1095 aa		10.61	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		10.61	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		10.61	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		10.61	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	IRGC	Q6NXR0	463 aa		10.61	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	LUZP1	Q86V48	1076 aa		10.61	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	ATCAY	Q86WG3	371 aa		10.61	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	BMPER	Q8N8U9	685 aa		10.61	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		10.61	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		10.61	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	FAF2	Q96CS3	445 aa		10.61	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		10.61	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	OR6C1	Q96RD1	312 aa		10.61	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	APMAP	Q9HDC9	416 aa		10.61	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	PDE7B	Q9NP56	450 aa		10.61	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	POLH	Q9Y253	713 aa		10.61	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	SYCE3	A1L190	88 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	ZNF487	B1APH4	448 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	NDST3	O95803	873 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	TNNT1	P13805	278 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	CASR	P41180	1078 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	GFER	P55789	205 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	TAS2R40	P59535	323 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	DYNLT1	P63172	113 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	ZBTB17	Q13105	803 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	PPP2R5E	Q16537	467 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	SLC18A3	Q16572	532 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	TEX19	Q8NA77	164 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	SEC14L1	Q92503	715 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	WDR24	Q96S15	920 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	CEP41	Q9BYV8	373 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	10.6	□□□□□ -0.71	6e-7	■■■■□ 23.7
UBIAD1-203	ENST00000483738	IFNK	Q9P0W0	207 aa		10.6	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	CDC14C	A4D256	554 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738		A6NCN8	305 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	MTSS1	O43312	755 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	SPOP	O43791	374 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	KCNJ13	O60928	360 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	PMPCB	O75439	489 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	KIAA0754	O94854	1291 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	DLGAP3	O95886	979 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	C9	P02748	559 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	GYPC	P04921	128 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	TMEM253	P0C7T8	217 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	ARHGAP25	P42331	645 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	CAPZB	P47756	277 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	KLRB1	Q12918	225 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	TFDP2	Q14188	446 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	SLC14A2	Q15849	920 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	VSIG1	Q86XK7	387 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	PQLC3	Q8N755	202 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	GPR26	Q8NDV2	337 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	RAPGEF5	Q92565	580 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	EPN3	Q9H201	632 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	TRABD	Q9H4I3	376 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	CROT	Q9UKG9	612 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	RARRES3	Q9UL19	164 aa		10.59	□□□□□ -0.71
UBIAD1-203	ENST00000483738	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71

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