RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 DOK1Q99704 481 aa16.09■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 MPP6Q9NZW5 540 aa16.09■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa16.09■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 TIMM22Q9Y584 194 aa16.09■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 HTTP42858 3142 aa16.09■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa16.09■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 CD68P34810 354 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 MTHFRP42898 656 aa16.09■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 CLEC14AQ86T13 490 aa16.09■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 TBC1D21Q8IYX1 336 aa16.09■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 LILRB4Q8NHJ6 448 aa16.09■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 MYRFLQ96LU7 910 aa16.09■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 HACD3Q9P035 362 aa16.09■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 ACTR3BQ9P1U1 418 aa16.09■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa16.09■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 COMMD10Q9Y6G5 202 aa16.09■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 HACD1B0YJ81 288 aa16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 TFECO14948 347 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 DCLK1O15075 740 aa16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 ITGB1P05556 798 aa16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 WARSP23381 471 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 PGFP49763 221 aa16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 ARSFP54793 590 aa16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 LAPTM4AQ15012 233 aa16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 SYT16Q17RD7 645 aa16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 TAC4Q86UU9 113 aa16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 TOP6BLQ8N6T0 577 aa16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 ITFG1Q8TB96 612 aa16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 HBEGFQ99075 208 aa16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF385DQ9H6B1 395 aa16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 RRAGCQ9HB90 399 aa16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 TRPV5Q9NQA5 729 aa16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 TMLHEQ9NVH6 421 aa16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 LRRC14BA6NHZ5 514 aa16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 IPO13O94829 963 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 DIO3P55073 304 aa16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 MADCAM1Q13477 382 aa16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 CAMK2BQ13554 666 aa16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 UGP2Q16851 508 aa16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 GLYATQ6IB77 296 aa16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 FUNDC1Q8IVP5 155 aa16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 TTC30BQ8N4P2 665 aa16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 CNIH3Q8TBE1 160 aa16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 ATL1Q8WXF7 558 aa16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 BIRC7Q96CA5 298 aa16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 GPR22Q99680 433 aa16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 SLAMF8Q9P0V8 285 aa16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 SBF1O95248 1867 aa16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 A8MT66 165 aa16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 RFPL2O75678 378 aa16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 SEC14L2O76054 403 aa16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 APOA1P02647 267 aa16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 CDC42EP1Q00587 391 aa16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 CYP2U1Q7Z449 544 aa16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 TUBA1CQ9BQE3 449 aa16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 FSD1LQ9BXM9 530 aa16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 MAP10Q9P2G4 905 aa16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 LIMD1Q9UGP4 676 aa16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 CRYL1Q9Y2S2 319 aa16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 ORC6Q9Y5N6 252 aa16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 ACOX3O15254 700 aa16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 AP2A1O95782 977 aa16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 SLC6A2P23975 617 aa16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 AXLP30530 894 aa16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 BNIP2Q12982 314 aa16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 CATSPEREQ5SY80 951 aa16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 AGAP9Q5VTM2 703 aa16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 MCOLN3Q8TDD5 553 aa16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 SLC30A3Q99726 388 aa16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 PRRG3Q9BZD7 231 aa16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 NDFIP2Q9NV92 336 aa16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 PLXNB2O15031 1838 aa16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 PIP5K1BO14986 540 aa16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 SOAT2O75908 522 aa16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 GRIK1P39086 918 aa16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 CHRNA4P43681 627 aa16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.5 ms