RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 HERPUD2Q9BSE4 406 aa9.3□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP9.3□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 DNPEPQ9ULA0 475 aa9.3□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 TTLL3Q9Y4R7 772 aa9.3□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 NAV3Q8IVL0 2385 aa9.3□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 TACC2O95359 2948 aa9.29□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa9.29□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A0G2JNG1 304 aa9.29□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa9.29□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 FADS2P1A8MWK0 482 aa9.29□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 KIR2DS3K7RE56 304 aa9.29□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 MATN3O15232 486 aa9.29□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 LRRTM2O43300 516 aa9.29□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 ZG16O60844 167 aa9.29□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 KIAA0754O94854 1291 aa9.29□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 HLA-DQB2P05538 268 aa9.29□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 F3P13726 295 aa9.29□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 CES1P23141 567 aa9.29□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 SPINT3P49223 89 aa9.29□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF165P49910 485 aa9.29□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 EPHA4P54764 986 aa9.29□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 GFERP55789 205 aa9.29□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 RPL26P61254 145 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 RPS18P62269 152 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 FOXM1Q08050 763 aa9.29□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 DNASE1L3Q13609 305 aa9.29□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 DPYSL3Q14195 570 aa9.29□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 KIR2DS5Q14953 304 aa9.29□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 CHRNA6Q15825 494 aa9.29□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 GDF7Q7Z4P5 450 aa9.29□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC9B2Q86UD5 537 aa9.29□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 LPCAT1Q8NF37 534 aa9.29□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM71BQ8TC56 605 aa9.29□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 LRRN4Q8WUT4 740 aa9.29□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 FATE1Q969F0 183 aa9.29□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 PNPLA2Q96AD5 504 aa9.29□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 SH3KBP1Q96B97 665 aa9.29□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 ELMO2Q96JJ3 720 aa9.29□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 LYSMD1Q96S90 227 aa9.29□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa9.29□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 THAP2Q9H0W7 228 aa9.29□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 ING2Q9H160 280 aa9.29□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM83DQ9H4H8 585 aa9.29□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 ACTL8Q9H568 366 aa9.29□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 PCDH9Q9HC56 1237 aa9.29□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 ACSS2Q9NR19 701 aa9.29□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 CPNE7Q9UBL6 633 aa9.29□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 ANAPC7Q9UJX3 599 aa9.29□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa9.29□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 PCSK5Q92824 1860 aa9.28□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 LILRA5A6NI73 299 aa9.28□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 GRID2O43424 1007 aa9.28□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 NUAK1O60285 661 aa9.28□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 DPM1O60762 260 aa9.28□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 CYP1A2P05177 515 aa9.28□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 ANKRD34CP0C6C1 535 aa9.28□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC2A4P14672 509 aa9.28□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 CA4P22748 312 aa9.28□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 VARSP26640 1264 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 SSR1P43307 286 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 ARSEP51690 589 aa9.28□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 ITGA1P56199 1179 aa9.28□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 GBE1Q04446 702 aa9.28□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 IL10RAQ13651 578 aa9.28□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 QPCTQ16769 361 aa9.28□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 ANO6Q4KMQ2 910 aa9.28□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 CCDC122Q5T0U0 273 aa9.28□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 CCDC183Q5T5S1 534 aa9.28□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 HGSNATQ68CP4 663 aa9.28□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa9.28□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 CPNE8Q86YQ8 564 aa9.28□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 PLXDC1Q8IUK5 500 aa9.28□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa9.28□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 CT55Q8WUE5 264 aa9.28□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 TSGA13Q96PP4 275 aa9.28□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa9.28□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 NUP85Q9BW27 656 aa9.28□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 NUDT9Q9BW91 350 aa9.28□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 EPB41L1Q9H4G0 881 aa9.28□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 RMI1Q9H9A7 625 aa9.28□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 ARFGAP3Q9NP61 516 aa9.28□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 OGFRQ9NZT2 677 aa9.28□□□□□ -0.92
SMARCE1-210ENST00000481231 IP6K2Q9UHH9 426 aa9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms