RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464454.1

CLK1-208, Transcript of CDC like kinase 1, human

TSL 2

Gene CLK1, Length 484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLK1-208	ENST00000464454	SLC30A6	Q6NXT4	461 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	WDR73	Q6P4I2	378 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	LMO3	Q8TAP4	145 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	TAAR8	Q969N4	342 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	C3orf30	Q96M34	536 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	GAREM1	Q9H706	876 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	NOX4	Q9NPH5	578 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	MALT1	Q9UDY8	824 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	PADI1	Q9ULC6	663 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	PROCR	Q9UNN8	238 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	VDAC3	Q9Y277	283 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	LRP12	Q9Y561	859 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	TAF1	P21675	1872 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	LNP1	A1A4G5	178 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	CLDN14	O95500	239 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	GH2	P01242	217 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	TPO	P07202	933 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	LIG4	P49917	911 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	ARSE	P51690	589 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	TAS2R38	P59533	333 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	KRTAP10-9	P60411	292 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	TMF1	P82094	1093 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	CXCL9	Q07325	125 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	GRAP	Q13588	217 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	C18orf63	Q68DL7	685 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	LCN10	Q6JVE6	187 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF280D	Q6N043	979 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	4.05	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	AACS	Q86V21	672 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	NRROS	Q86YC3	692 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	KCTD6	Q8NC69	237 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	TANK	Q92844	425 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	TMCO6	Q96DC7	493 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	CMKLR1	Q99788	373 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	SEMA3C	Q99985	751 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	DNAJC18	Q9H819	358 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	FBXL2	Q9UKC9	423 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454		A0A1B0GUV1	79 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	hCG_1809904	A0A1W2PP81	198 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454		A0A1W2PPE2	198 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454		A0A1W2PR64	198 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454		A6NL46	340 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	CLGN	O14967	610 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	RSL1D1	O76021	490 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	KDM4B	O94953	1096 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	KCNK5	O95279	499 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	LINC00271	P0C7V0	271 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	PRLR	P16471	622 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	PDE1B	Q01064	536 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	SPOCK1	Q08629	439 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	KRT33B	Q14525	404 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	RASA2	Q15283	850 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	GPR180	Q86V85	440 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	EMC1	Q8N766	993 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	POGLUT1	Q8NBL1	392 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	THAP6	Q8TBB0	222 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	PTPMT1	Q8WUK0	201 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	TMEM19	Q96HH6	336 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	IL17F	Q96PD4	163 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	ABHD1	Q96SE0	405 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	CSF3R	Q99062	836 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	MMP27	Q9H306	513 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		4.04	□□□□□ -1.76

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