RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa16.62■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 TBC1D29Q9UFV1 150 aa16.62■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC23A2Q9UGH3 650 aa16.62■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 KLK13Q9UKR3 277 aa16.62■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 KCNK6Q9Y257 313 aa16.62■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 NCOR2Q9Y618 2525 aa16.62■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa16.61■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 KLHL33A6NCF5 533 aa16.61■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 CCL22O00626 93 aa16.61■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 RALBP11234 206 aa16.61■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC2A4P14672 509 aa16.61■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 VCLP18206 1134 aa16.61■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 SPINK2P20155 84 aa16.61■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 PTGIRP43119 386 aa16.61■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 ARSDP51689 593 aa16.61■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 DMPKQ09013 629 aa16.61■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 PPP1R7Q15435 360 aa16.61■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 HES3Q5TGS1 186 aa16.61■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 IYDQ6PHW0 289 aa16.61■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM220Q6QAJ8 160 aa16.61■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 CRTC3Q6UUV7 619 aa16.61■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 WASH2PQ6VEQ5 465 aa16.61■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF534Q76KX8 674 aa16.61■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF438Q7Z4V0 828 aa16.61■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 C11orf96Q7Z7L8 435 aa16.61■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa16.61■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 SFTPA2Q8IWL1 248 aa16.61■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 SFRP1Q8N474 314 aa16.61■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa16.61■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 OR13J1Q8NGT2 312 aa16.61■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 DCUN1D1Q96GG9 259 aa16.61■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 COPS8Q99627 209 aa16.61■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 CCDC3Q9BQI4 270 aa16.61■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 KIFC1Q9BW19 673 aa16.61■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 WASH6PQ9NQA3 447 aa16.61■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 KLC4Q9NSK0 619 aa16.61■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 LRIT1Q9P2V4 623 aa16.61■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 CLCA2Q9UQC9 943 aa16.61■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 RNF215Q9Y6U7 377 aa16.61■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 CCDC162PA2VCL2 907 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 A6NCN8 305 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 CFAP99D6REC4 459 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 ZW10O43264 779 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 TCEA3O75764 348 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 POP7O75817 140 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 MT-CO3P00414 261 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 F3P13726 295 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 ACRV1P26436 265 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 AKT1P31749 480 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 GPR3P46089 330 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 FASLGP48023 281 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 CTSCP53634 463 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 PTK6Q13882 451 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 NR1D2Q14995 579 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 INSCQ1MX18 579 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 BCL7AQ4VC05 210 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 SYT10Q6XYQ8 523 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 AMZ2Q86W34 360 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 SERPINA9Q86WD7 417 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 HDAC10Q969S8 669 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 CCDC74AQ96AQ1 378 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 GRAMD1AQ96CP6 724 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF778Q96MU6 729 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM96AQ9H5X1 160 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 CHRAC1Q9NRG0 131 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A0G2JNG1 304 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 MAGEB16A2A368 324 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 KIR2DS3K7RE56 304 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 EML2O95834 649 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 IDSP22304 550 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 FOXN2P32314 431 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 MAZP56270 477 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 B4GALNT1Q00973 533 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 ITIH4Q14624 930 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 KIR2DS5Q14953 304 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 AGAP9Q5VTM2 703 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 ANKRD22Q5VYY1 191 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 AFTPHQ6ULP2 937 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 CERS6Q6ZMG9 384 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 TAS2R42Q7RTR8 314 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 PCGF5Q86SE9 256 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 PPIL6Q8IXY8 311 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 NAT8LQ8N9F0 302 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 AVL9Q8NBF6 648 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 OR4L1Q8NH43 312 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 SGF29Q96ES7 293 aa16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms