RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 ANGPTL1O95841 491 aa6.63□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 FABP3P05413 133 aa6.63□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 NT5EP21589 574 aa6.63□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 GLRA2P23416 452 aa6.63□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 OR3A3P47888 321 aa6.63□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 OR3A2P47893 321 aa6.63□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 TPSAB1Q15661 275 aa6.63□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 LHX5Q9H2C1 402 aa6.63□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 SLC6A15Q9H2J7 730 aa6.63□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa6.63□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa6.63□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 SLITRK4Q8IW52 837 aa6.63□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 ARMC10Q8N2F6 343 aa6.63□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 UFD1Q92890 307 aa6.63□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 NXPE2Q96DL1 559 aa6.63□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 H3BUI4 141 aa6.63□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 UNC5BQ8IZJ1 945 aa6.63□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 LRATO95237 230 aa6.62□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 GLYATQ6IB77 296 aa6.62□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 AZIN2Q96A70 460 aa6.62□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 MARK4Q96L34 752 aa6.62□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 IDI2Q9BXS1 227 aa6.62□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 MCCC2Q9HCC0 563 aa6.62□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 CHST7Q9NS84 486 aa6.62□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 NUDT4Q9NZJ9 180 aa6.62□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 MID1O15344 667 aa6.62□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 ZNF12P17014 697 aa6.62□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 RPS9P46781 194 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 CDKL1Q00532 357 aa6.62□□□□□ -1.35
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