RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412640.6

SOX9-AS1-201, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 635 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MRGPRX3Q96LB0 322 aa9.5□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF599Q96NL3 588 aa9.5□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CYTH2Q99418 400 aa9.5□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CENPHQ9H3R5 247 aa9.5□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LRRC40Q9H9A6 602 aa9.5□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GLOD4Q9HC38 313 aa9.5□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MOCS1Q9NZB8 636 aa9.5□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RSPH14Q9UHP6 348 aa9.5□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KLF15Q9UIH9 416 aa9.5□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa9.5□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CHMP2BQ9UQN3 213 aa9.5□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TTLL3Q9Y4R7 772 aa9.5□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SDK2Q58EX2 2172 aa9.5□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SCN8AQ9UQD0 1980 aa9.5□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ARHGAP10A1A4S6 786 aa9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MAGEB16A2A368 324 aa9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TTLL8A6PVC2 850 aa9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NKX2-8O15522 239 aa9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 AQP9O43315 295 aa9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RAMP2O60895 175 aa9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ANXA9O76027 345 aa9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ADRA1AP35348 466 aa9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MDH1P40925 334 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLCO1A2P46721 670 aa9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NPY2RP49146 381 aa9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LMAN1P49257 510 aa9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RENBPP51606 427 aa9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC18A1P54219 525 aa9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CCL7P80098 99 aa9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 UNC5AQ6ZN44 842 aa9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 Q6ZSR6 202 aa9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LINC00523Q86TU6 105 aa9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 EXOC3L1Q86VI1 746 aa9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LGI2Q8N0V4 545 aa9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GSDMBQ8TAX9 411 aa9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PRR7Q8TB68 274 aa9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CPT1CQ8TCG5 803 aa9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LMX1AQ8TE12 382 aa9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC44A1Q8WWI5 657 aa9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NAT6Q93015 286 aa9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NKD1Q969G9 470 aa9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MARVELD3Q96A59 401 aa9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TADA1Q96BN2 335 aa9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IFT43Q96FT9 208 aa9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HMCESQ96FZ2 354 aa9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TCTN2Q96GX1 697 aa9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 AGAP3Q96P47 875 aa9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CATSPER2Q96P56 530 aa9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CAPS2Q9BXY5 557 aa9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CEP41Q9BYV8 373 aa9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MAGEH1Q9H213 219 aa9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PRDM8Q9NQV8 689 aa9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SENP1Q9P0U3 644 aa9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF180Q9UJW8 692 aa9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DNHD1Q96M86 4753 aa9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 AKAP9Q99996 3911 aa9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CSMD2Q7Z408 3487 aa9.49□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa9.48□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ILVBLA1L0T0 632 aa9.48□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TCAF2A6NFQ2 919 aa9.48□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FAM159BA6NKW6 160 aa9.48□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SMIM23A6NLE4 172 aa9.48□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 EFCAB7A8K855 629 aa9.48□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 D6RAR5 112 aa9.48□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa9.48□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DUX1O43812 170 aa9.48□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PRAMEF11O60813 436 aa9.48□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CPP00450 1065 aa9.48□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PGAM1P18669 254 aa9.48□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR1E1P30953 314 aa9.48□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CSKP41240 450 aa9.48□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RPIAP49247 311 aa9.48□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GEMP55040 296 aa9.48□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NAB1Q13506 487 aa9.48□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FZD2Q14332 565 aa9.48□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC14A2Q15849 920 aa9.48□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DEFB109BQ30KR1 87 aa9.48□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FAM182AQ5T1J6 154 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57 ms