RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328834.9

CNOT10-201, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNOT10, Length 2,815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT10-201ENST00000328834 UGT1A1P22309 533 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 UGT1A4P22310 534 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 ALDH4A1P30038 563 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 UGT1A3P35503 534 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 UGT1A5P35504 534 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 ERVPABLB-1P60509 514 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 ZNF33AQ06730 810 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 GLYATQ6IB77 296 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 LCN8Q6JVE9 175 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 MRNIPQ6NTE8 343 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 FNDC8Q8TC99 324 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 PROKR1Q8TCW9 393 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 FBXO32Q969P5 355 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 LINGO1Q96FE5 620 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 SLC39A13Q96H72 371 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 PCDH12Q9NPG4 1184 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 SQORQ9Y6N5 450 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 A0A1W2PP18 115 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 SNX2O60749 519 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 NDUFS3O75489 264 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 RASAL1O95294 804 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 RHOQP17081 205 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 AGXTP21549 392 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 CTGFP29279 349 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 CYP2C18P33260 490 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 MORN1Q5T089 497 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 ANKS6Q68DC2 871 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 IL27RAQ6UWB1 636 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 PHACTR4Q8IZ21 702 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 SLC22A15Q8IZD6 547 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 CLEC4FQ8N1N0 589 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 C9orf16Q9BUW7 83 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 NTN4Q9HB63 628 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 ZFP14Q9HCL3 533 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 PRDM8Q9NQV8 689 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 GID8Q9NWU2 228 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 TLR6Q9Y2C9 796 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 GREB1Q4ZG55 1949 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 DFNA5O60443 496 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 HSD17B1P14061 328 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 SLC6A4P31645 630 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 PIGAP37287 484 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 LSM3P62310 102 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 FPGSQ05932 587 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 TUSC3Q13454 348 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 SERINC3Q13530 473 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 Q6ZSR9 355 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 TAS2R42Q7RTR8 314 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 SFRP1Q8N474 314 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 TMBIM1Q969X1 311 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 TRMOQ9BU70 441 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 CCDC68Q9H2F9 335 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 NLRC5Q86WI3 1866 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 UPK3BL1B0FP48 263 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 UPK3BL2E5RIL1 263 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 LDLRP01130 860 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 CAPN1P07384 714 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 IRF1P10914 325 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 CTPS1P17812 591 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 RPL9P32969 192 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 CAPGP40121 348 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 HMGCS1Q01581 520 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 BFSP2Q13515 415 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 MEP1AQ16819 746 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 C6orf136Q5SQH8 315 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 GALNT10Q86SR1 603 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 C10orf111Q8N326 155 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 HM13Q8TCT9 377 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 SEPT8Q92599 483 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 ZUFSPQ96AP4 578 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 FEM1CQ96JP0 617 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 CSF3RQ99062 836 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 TMEM248Q9NWD8 314 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 PCTPQ9UKL6 214 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 AQP12BA6NM10 295 aa14.66□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 PTGES3LE9PB15 166 aa14.66□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 M0QZQ0 153 aa14.66□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 CELF2O95319 508 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 RCAN2Q14206 197 aa14.66□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 ADRM1Q16186 407 aa14.66□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 HACD2Q6Y1H2 254 aa14.66□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa14.66□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 TRIM74Q86UV6 250 aa14.66□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 TRIM73Q86UV7 250 aa14.66□□□□□ -0.06
CNOT10-201ENST00000328834 AQP12AQ8IXF9 295 aa14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms