RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 SYTL2Q9HCH5 934 aa16.49■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 TIGARQ9NQ88 270 aa16.49■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 RNF181Q9P0P0 153 aa16.49■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 ATPIF1Q9UII2 106 aa16.49■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 FAM50BQ9Y247 325 aa16.49■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 OR2B3O76000 313 aa16.49■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 CYP3A5P20815 502 aa16.49■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 ZMYM5Q9UJ78 669 aa16.49■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 BAIAP2Q9UQB8 552 aa16.49■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 NME4O00746 187 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 PDPK1O15530 556 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 OXTRP30559 389 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 RACK1P63244 317 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 STARD3Q14849 445 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 CRY1Q16526 586 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 ZPBP2Q6X784 338 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 TMEM39BQ9GZU3 492 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 LYPLA2O95372 231 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 AP2A1O95782 977 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 MT-ND2P03891 347 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 CYP4F8P98187 520 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 COX10Q12887 443 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 ANGPT1Q15389 498 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 GPR158Q5T848 1215 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 SLC39A4Q6P5W5 647 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 FBXL18Q96ME1 805 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 CNPPD1Q9BV87 410 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 MPP6Q9NZW5 540 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 SNED1Q8TER0 1413 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 GLP2RO95838 553 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 CYBBP04839 570 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 CLCN5P51795 746 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 CD47Q08722 323 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 NIPA1Q7RTP0 329 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 MICALL2Q8IY33 904 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 MYRFLQ96LU7 910 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 ITPAQ9BY32 194 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 PRKD2Q9BZL6 878 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 RNF6Q9Y252 685 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 TMX2Q9Y320 296 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 VWA7Q9Y334 891 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 AGXTP21549 392 aa16.47■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 CCR1P32246 355 aa16.47■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 TALDO1P37837 337 aa16.47■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 TP53BP2Q13625 1128 aa16.47■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 HBEGFQ99075 208 aa16.47■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 SLC30A2Q9BRI3 323 aa16.47■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 LRRC3Q9BY71 257 aa16.47■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 G3V2L1 256 aa16.47■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 SLC1A7O00341 560 aa16.47■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 BTN3A1O00481 513 aa16.47■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 PLA2G6O60733 806 aa16.47■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 ADIGQ0VDE8 80 aa16.47■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 LAPTM4AQ15012 233 aa16.47■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP16.47■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 KATNAL1Q9BW62 490 aa16.47■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 ANKHQ9HCJ1 492 aa16.47■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 ZFP14Q9HCL3 533 aa16.47■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 SNTG1Q9NSN8 517 aa16.47■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 SEC22BO75396 215 aa16.47■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 IFNA16P05015 189 aa16.47■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP16.47■□□□□ 0.235e-6■■■□□ 15.7
PACS1-201ENST00000320580 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 CXCL9Q07325 125 aa16.47■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 SPP2Q13103 211 aa16.47■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 BTLAQ7Z6A9 289 aa16.47■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 OR5K1Q8NHB7 308 aa16.47■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 RHOXF1Q8NHV9 184 aa16.47■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 FRMD6Q96NE9 622 aa16.47■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 SLA2Q9H6Q3 261 aa16.47■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa16.47■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 ELOVL7A1L3X0 281 aa16.47■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 DNAJB5O75953 348 aa16.47■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 JUNP05412 331 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 DNAJB2P25686 324 aa16.47■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 HTR1BP28222 390 aa16.47■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 DPP6P42658 865 aa16.47■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 ZNF235Q14590 738 aa16.47■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 ZNF549Q6P9A3 640 aa16.47■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 PQLC3Q8N755 202 aa16.47■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
PACS1-201ENST00000320580 STYXQ8WUJ0 223 aa16.47■□□□□ 0.23
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