RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 GPR89BP0CG08 455 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 RALBP11234 206 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 ARNTP27540 789 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 ELOCQ15369 112 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 DBN1Q16643 649 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 TEX35Q5T0J7 233 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 DET1Q7L5Y6 550 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC25Q86WR0 208 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 ZBED8Q8IZ13 594 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 SLC25A45Q8N413 288 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 SGSM3Q96HU1 749 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 CLPBQ9H078 707 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 TEX264Q9Y6I9 313 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 NEMP2A6NFY4 417 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 OR2AG2A6NM03 316 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 E7ESA3 106 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 TTC4O95801 387 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 CD59P13987 128 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 SEMA3AQ14563 771 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 CRYMQ14894 314 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 CCNJLQ8IV13 435 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 FBXO36Q8NEA4 188 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 CCL4L1Q8NHW4 92 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 NAT14Q8WUY8 206 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 TTC1Q99614 292 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 BOCQ9BWV1 1114 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 SAYSD1Q9NPB0 183 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 DOLKQ9UPQ8 538 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 CFAP99D6REC4 459 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 CHUKO15111 745 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 B4GALNT1Q00973 533 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 LONRF1Q17RB8 773 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 LRRTM4Q86VH4 590 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 HEXDCQ8WVB3 486 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 SGF29Q96ES7 293 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 FAM169AQ9Y6X4 670 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 FLRT2O43155 660 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 ACP5P13686 325 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 CTSCP53634 463 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 CTBSQ01459 385 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 DEFB133Q30KQ1 61 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 INAVAQ3KP66 663 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 SPANXN3Q5MJ09 141 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 MRNIPQ6NTE8 343 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM220Q6QAJ8 160 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 CERS6Q6ZMG9 384 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 TAF8Q7Z7C8 310 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 GKN2Q86XP6 184 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 EID2Q8N6I1 236 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 BTBD3Q9Y2F9 522 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 PCNX2A6NKB5 2137 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 KMOO15229 486 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP22.03■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 SH3BP5O60239 455 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 ANXA6P08133 673 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 AK4P27144 223 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 PMLP29590 882 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 GRK6P43250 576 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 ITIH4Q14624 930 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 NEPROQ6NW34 567 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 UNC5AQ6ZN44 842 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 DBX2Q6ZNG2 339 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF547Q8IVP9 402 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 NAXDQ8IW45 347 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 IFT20Q8IY31 132 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 UNC5BQ8IZJ1 945 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 RHBDD1Q8TEB9 315 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 PYROXD1Q8WU10 500 aa22.03■■□□□ 1.12
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