RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC28BQ9BUN5 200 aa22.51■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 LOC100653049A0A140TA62 436 aa22.5■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 LINC01565O15544 149 aa22.5■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 KRT34O76011 436 aa22.5■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 CDK14O94921 469 aa22.5■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 TIMP2P16035 220 aa22.5■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 FCARP24071 287 aa22.5■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 ARHGEF7Q14155 803 aa22.5■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 TANGO2Q6ICL3 276 aa22.5■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 GPR149Q86SP6 731 aa22.5■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 MCUR1Q96AQ8 359 aa22.5■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 FAR2Q96K12 515 aa22.5■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 MARK4Q96L34 752 aa22.5■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 CATSPER2Q96P56 530 aa22.5■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa22.5■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 FAM83CQ9BQN1 747 aa22.5■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 SLC28A3Q9HAS3 691 aa22.5■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 PCDH12Q9NPG4 1184 aa22.5■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 MSRAQ9UJ68 235 aa22.5■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 KLK8O60259 260 aa22.5■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 AGTR2P50052 363 aa22.5■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 VASPP50552 380 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 ST8SIA6P61647 398 aa22.5■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 NAA25Q14CX7 972 aa22.5■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 MACC1Q6ZN28 852 aa22.5■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 GPSM1Q86YR5 675 aa22.5■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 SFTPA1Q8IWL2 248 aa22.5■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 TRPC4APQ8TEL6 797 aa22.5■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 DZANK1Q9NVP4 752 aa22.5■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 PLA2G4CQ9UP65 541 aa22.5■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 VIPR1P32241 457 aa22.49■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 MXRA7P84157 204 aa22.49■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa22.49■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa22.49■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 MID1IP1Q9NPA3 183 aa22.49■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 HPS4Q9NQG7 708 aa22.49■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa22.49■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 GDE1Q9NZC3 331 aa22.49■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 DEC1Q9P2X7 70 aa22.49■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 TSPAN11A1L157 253 aa22.49■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 UPK3BL1B0FP48 263 aa22.49■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 UPK3BL2E5RIL1 263 aa22.49■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 COPAP53621 1224 aa22.49■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 B4GALNT1Q00973 533 aa22.49■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 TGFBIQ15582 683 aa22.49■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF805Q5CZA5 627 aa22.49■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 ESAMQ96AP7 390 aa22.49■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 CMTM5Q96DZ9 223 aa22.49■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 COPS8Q99627 209 aa22.49■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF385DQ9H6B1 395 aa22.49■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 MEAF6Q9HAF1 191 aa22.49■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa22.49■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 CEP290O15078 2479 aa22.48■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 A0A1B0GTL3 188 aa22.48■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 NSG1P42857 185 aa22.48■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 CLCQ05315 142 aa22.48■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 PKD2L2Q9NZM6 624 aa22.48■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 CD274Q9NZQ7 290 aa22.48■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 RPS17P08708 135 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 HLA-EP13747 358 aa22.48■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF30P17039 623 aa22.48■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 CPOXP36551 454 aa22.48■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 PGM1P36871 562 aa22.48■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 FOXA1P55317 472 aa22.48■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 ACSBG2Q5FVE4 666 aa22.48■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 GPRC6AQ5T6X5 926 aa22.48■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa22.48■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 ANKS6Q68DC2 871 aa22.48■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 SYCE2Q6PIF2 218 aa22.48■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 VITQ6UXI7 678 aa22.48■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 CYHR1Q6ZMK1 362 aa22.48■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 CEP70Q8NHQ1 597 aa22.48■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 SCAMP4Q969E2 229 aa22.48■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 ASB2Q96Q27 587 aa22.48■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 ASB1Q9Y576 335 aa22.48■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 C16orf96A6NNT2 1141 aa22.47■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa22.47■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 STX16O14662 325 aa22.47■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 SNX2O60749 519 aa22.47■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 COX4I1P13073 169 aa22.47■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 SLC25A3Q00325 362 aa22.47■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 SATB1Q01826 763 aa22.47■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 UGT3A2Q3SY77 523 aa22.47■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 SBSNQ6UWP8 590 aa22.47■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 Q6ZVL8 140 aa22.47■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 CLYBLQ8N0X4 340 aa22.47■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 ZBTB2Q8N680 514 aa22.47■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 LRIG1Q96JA1 1093 aa22.47■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 SPATA16Q9BXB7 569 aa22.47■■□□□ 1.19
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