RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285681.6

USP25-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,216 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-202ENST00000285681 SLC43A3Q8NBI5 491 aa20.08■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 MYDGFQ969H8 173 aa20.08■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa20.08■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 SLC35G6P0C7Q6 338 aa20.08■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 SCNN1AP37088 669 aa20.08■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 MAPK10P53779 464 aa20.08■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 ZNF792Q3KQV3 632 aa20.08■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 LDLRAP1Q5SW96 308 aa20.08■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 SULT1C3Q6IMI6 304 aa20.08■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 GALNT18Q6P9A2 607 aa20.08■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 CCDC28BQ9BUN5 200 aa20.08■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 NUAK2Q9H093 628 aa20.08■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 ENPP3O14638 875 aa20.07■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 SPIRE1Q08AE8 756 aa20.07■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 KLF10Q13118 480 aa20.07■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 PDGFRLQ15198 375 aa20.07■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 RFX4Q33E94 735 aa20.07■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 GK5Q6ZS86 529 aa20.07■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 XAGE5Q8WWM1 108 aa20.07■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 CLDND1Q9NY35 253 aa20.07■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 ERGIC3Q9Y282 383 aa20.07■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 F2P00734 622 aa20.07■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 GTF2H2Q13888 395 aa20.07■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa20.07■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 MSANTD2Q6P1R3 559 aa20.07■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 AMIGO2Q86SJ2 522 aa20.07■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 UNC5BQ8IZJ1 945 aa20.07■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 ENTPD5O75356 428 aa20.07■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 KCNJ2P63252 427 aa20.07■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 LGALS3BPQ08380 585 aa20.07■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa20.07■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 CPNE9Q8IYJ1 553 aa20.07■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 SLC47A1Q96FL8 570 aa20.07■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 TM7SF2O76062 418 aa20.07■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 FSHRP23945 695 aa20.07■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 SLC1A5Q15758 541 aa20.07■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 IL23RQ5VWK5 629 aa20.07■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 IZUMO1Q8IYV9 350 aa20.07■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 NIPA2Q8N8Q9 360 aa20.07■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa20.07■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 SPOCK2Q92563 424 aa20.07■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 SNED1Q8TER0 1413 aa20.06■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 KRT36O76013 467 aa20.06■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 C8GP07360 202 aa20.06■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 NT5EP21589 574 aa20.06■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 HDDC2Q7Z4H3 204 aa20.06■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 UXS1Q8NBZ7 420 aa20.06■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 ZNF540Q8NDQ6 660 aa20.06■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 UNC93B1Q9H1C4 597 aa20.06■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 BLKP51451 505 aa20.06■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 ECT2LQ008S8 904 aa20.06■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 TMEM63BQ5T3F8 832 aa20.06■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 BCAS3Q9H6U6 928 aa20.06■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 SEC14L3Q9UDX4 400 aa20.06■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 ADGRE2Q9UHX3 823 aa20.06■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 IFT172Q9UG01 1749 aa20.06■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 OR1F1O43749 312 aa20.06■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 TTKP33981 857 aa20.06■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 MAPK12P53778 367 aa20.06■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 PNLIPRP1P54315 467 aa20.06■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 MINDY4Q4G0A6 757 aa20.06■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 C2orf27AQ580R0 203 aa20.06■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 PPM1MQ96MI6 270 aa20.06■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 FCRL5Q96RD9 977 aa20.06■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 SLC38A3Q99624 504 aa20.06■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 ADAMTS3O15072 1205 aa20.06■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 WBP4O75554 376 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 UROSP10746 265 aa20.06■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 IGFALSP35858 605 aa20.06■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 FBXO48Q5FWF7 155 aa20.06■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 BROXQ5VW32 411 aa20.06■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 ERICH5Q6P6B1 374 aa20.06■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 ISLR2Q6UXK2 745 aa20.06■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 C7orf26Q96N11 449 aa20.06■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 ZNF599Q96NL3 588 aa20.06■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 ACSS2Q9NR19 701 aa20.06■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 KCNE1P15382 129 aa20.05■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 JAG1P78504 1218 aa20.05■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 TMEM110Q86TL2 294 aa20.05■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 MGRN1O60291 552 aa20.05■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 MFN2O95140 757 aa20.05■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 ANPEPP15144 967 aa20.05■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 KCTD13Q8WZ19 329 aa20.05■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 PCBD2Q9H0N5 130 aa20.05■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 TFPIP10646 304 aa20.05■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
USP25-202ENST00000285681 RAB30Q15771 203 aa20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms