RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282999.7

SRP19-201, Transcript of signal recognition particle 19, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SRP19, Length 937 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP19-201ENST00000282999 THRAP10827 490 aa15.98■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 VCLP18206 1134 aa15.98■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 ITIH1P19827 911 aa15.98■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 CD82P27701 267 aa15.98■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 CSF2RBP32927 897 aa15.98■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 CLN3Q13286 438 aa15.98■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 ITGA9Q13797 1035 aa15.98■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 C16orf72Q14CZ0 275 aa15.98■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 TMEM164Q5U3C3 297 aa15.98■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 NKAIN2Q5VXU1 208 aa15.98■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 TMEM71Q6P5X7 295 aa15.98■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 CCDC112Q8NEF3 446 aa15.98■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 GDAP1Q8TB36 358 aa15.98■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 SPATA13Q96N96 652 aa15.98■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 TTC25Q96NG3 672 aa15.98■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 FICDQ9BVA6 458 aa15.98■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 C10orf88Q9H8K7 445 aa15.98■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 IL26Q9NPH9 171 aa15.98■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa15.97■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 STX7O15400 261 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 KCNJ13O60928 360 aa15.97■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 MTX2O75431 263 aa15.97■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 PSMB4P28070 264 aa15.97■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 MAPK10P53779 464 aa15.97■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 VAC14Q08AM6 782 aa15.97■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 LDLRAP1Q5SW96 308 aa15.97■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 RANBP10Q6VN20 620 aa15.97■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 SPC24Q8NBT2 197 aa15.97■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 AGBL5Q8NDL9 886 aa15.97■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 DDHD1Q8NEL9 900 aa15.97■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa15.97■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 GORASP1Q9BQQ3 440 aa15.97■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 DESI2Q9BSY9 194 aa15.97■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 UCK1Q9HA47 277 aa15.97■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 PRDM8Q9NQV8 689 aa15.97■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 SMOXQ9NWM0 555 aa15.97■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 PDP2Q9P2J9 529 aa15.97■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 CPNE7Q9UBL6 633 aa15.97■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa15.97■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa15.96■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 C5orf60A6NFR6 353 aa15.96■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 LILRA5A6NI73 299 aa15.96■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 PRR19A6NJB7 356 aa15.96■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 C2orf81A6NN90 581 aa15.96■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 TK2O00142 265 aa15.96■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 PRAMEF10O60809 474 aa15.96■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 AGTP01019 485 aa15.96■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 LIPCP11150 499 aa15.96■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 LPOP22079 712 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP15.96■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 ADRA1AP35348 466 aa15.96■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 ETV5P41161 510 aa15.96■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 EMP3P54852 163 aa15.96■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 GSDMDP57764 484 aa15.96■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 PDE1BQ01064 536 aa15.96■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 RHDQ02161 417 aa15.96■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 NFATC2Q13469 925 aa15.96■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 CHRNA6Q15825 494 aa15.96■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa15.96■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 AADACL2Q6P093 401 aa15.96■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 FAM151BQ6UXP7 276 aa15.96■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 WASH2PQ6VEQ5 465 aa15.96■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa15.96■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 ZNF547Q8IVP9 402 aa15.96■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 RCBTB1Q8NDN9 531 aa15.96■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 USP7Q93009 1102 aa15.96■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 C19orf43Q9BQ61 176 aa15.96■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 TSGA10Q9BZW7 698 aa15.96■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 CPNE5Q9HCH3 593 aa15.96■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 WASH6PQ9NQA3 447 aa15.96■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 TRIM10Q9UDY6 481 aa15.96■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa15.96■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
SRP19-201ENST00000282999 PDZK1P1A8MUH7 402 aa15.95■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 K7ENP7 123 aa15.95■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 FTCDO95954 541 aa15.95■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 IDSP22304 550 aa15.95■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 CFHR1Q03591 330 aa15.95■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 ARHGAP40Q5TG30 622 aa15.95■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 AGAP9Q5VTM2 703 aa15.95■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms