RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 LRSAM1Q6UWE0 723 aa25.17■■□□□ 1.62
PMS1-222ENST00000639501 DCTPP1Q9H773 170 aa25.17■■□□□ 1.62
PMS1-222ENST00000639501 NFE2L2Q16236 605 aa25.16■■□□□ 1.62
PMS1-222ENST00000639501 C8orf58Q8NAV2 365 aa25.16■■□□□ 1.62
PMS1-222ENST00000639501 SDSP20132 328 aa25.16■■□□□ 1.62
PMS1-222ENST00000639501 RNF214Q8ND24 703 aa25.16■■□□□ 1.62
PMS1-222ENST00000639501 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
PMS1-222ENST00000639501 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
PMS1-222ENST00000639501 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
PMS1-222ENST00000639501 TERF2IPQ9NYB0 399 aa25.15■■□□□ 1.62
PMS1-222ENST00000639501 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
PMS1-222ENST00000639501 KIF20BQ96Q89 1820 aa25.14■■□□□ 1.61
PMS1-222ENST00000639501 ATP10DQ9P241 1426 aa25.13■■□□□ 1.61
PMS1-222ENST00000639501 MAP7D2Q96T17 732 aa25.13■■□□□ 1.61
PMS1-222ENST00000639501 PIK3C2BO00750 1634 aa25.13■■□□□ 1.61
PMS1-222ENST00000639501 ZNF853P0CG23 659 aa25.13■■□□□ 1.61
PMS1-222ENST00000639501 ZFYVE9O95405 1425 aa25.12■■□□□ 1.61
PMS1-222ENST00000639501 APBB1O00213 710 aa25.12■■□□□ 1.61
PMS1-222ENST00000639501 ST18O60284 1047 aa25.12■■□□□ 1.61
PMS1-222ENST00000639501 IFT57Q9NWB7 429 aa25.12■■□□□ 1.61
PMS1-222ENST00000639501 PTPRMP28827 1452 aa25.12■■□□□ 1.61
PMS1-222ENST00000639501 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
PMS1-222ENST00000639501 GNAI1P63096 354 aa25.11■■□□□ 1.61
PMS1-222ENST00000639501 IDI1Q13907 227 aa25.11■■□□□ 1.61
PMS1-222ENST00000639501 POLKQ9UBT6 870 aa25.11■■□□□ 1.61
PMS1-222ENST00000639501 CCDC39Q9UFE4 941 aa25.1■■□□□ 1.61
PMS1-222ENST00000639501 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.1■■□□□ 1.61
PMS1-222ENST00000639501 DYNC1I1O14576 645 aa25.09■■□□□ 1.61
PMS1-222ENST00000639501 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
PMS1-222ENST00000639501 ZBTB7CA1YPR0 619 aa25.09■■□□□ 1.61
PMS1-222ENST00000639501 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa25.09■■□□□ 1.61
PMS1-222ENST00000639501 PRAM1Q96QH2 718 aa25.09■■□□□ 1.61
PMS1-222ENST00000639501 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.09■■□□□ 1.61
PMS1-222ENST00000639501 MCM5P33992 734 aa25.08■■□□□ 1.61
PMS1-222ENST00000639501 SASS6Q6UVJ0 657 aa25.08■■□□□ 1.61
PMS1-222ENST00000639501 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP25.08■■□□□ 1.61
PMS1-222ENST00000639501 DLG5Q8TDM6 1919 aa25.08■■□□□ 1.6
PMS1-222ENST00000639501 FAM83GA6ND36 823 aa25.08■■□□□ 1.6
PMS1-222ENST00000639501 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.6
PMS1-222ENST00000639501 ANKRD44Q8N8A2 993 aa25.07■■□□□ 1.6
PMS1-222ENST00000639501 CABP1Q9NZU7 370 aa25.06■■□□□ 1.6
PMS1-222ENST00000639501 CFAP44Q96MT7 982 aa25.06■■□□□ 1.6
PMS1-222ENST00000639501 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
PMS1-222ENST00000639501 DCTN1Q14203 1278 aa25.05■■□□□ 1.6
PMS1-222ENST00000639501 CEP85Q6P2H3 762 aa25.05■■□□□ 1.6
PMS1-222ENST00000639501 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
PMS1-222ENST00000639501 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa25.05■■□□□ 1.6
PMS1-222ENST00000639501 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.05■■□□□ 1.6
PMS1-222ENST00000639501 RGS12O14924 1447 aa25.04■■□□□ 1.6
PMS1-222ENST00000639501 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
PMS1-222ENST00000639501 KRT24Q2M2I5 525 aa25.04■■□□□ 1.6
PMS1-222ENST00000639501 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP25.04■■□□□ 1.6
PMS1-222ENST00000639501 MPNDQ8N594 471 aa25.04■■□□□ 1.6
PMS1-222ENST00000639501 TMX3Q96JJ7 454 aa25.04■■□□□ 1.6
PMS1-222ENST00000639501 PRDM10Q9NQV6 1147 aa25.03■■□□□ 1.6
PMS1-222ENST00000639501 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.03■■□□□ 1.6
PMS1-222ENST00000639501 MSH6P52701 1360 aa25.02■■□□□ 1.6
PMS1-222ENST00000639501 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.02■■□□□ 1.6
PMS1-222ENST00000639501 CASC1Q6TDU7 716 aa25.02■■□□□ 1.6
PMS1-222ENST00000639501 KIF24Q5T7B8 1368 aa25.02■■□□□ 1.6
PMS1-222ENST00000639501 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.02■■□□□ 1.6
PMS1-222ENST00000639501 REC8O95072 547 aa25.01■■□□□ 1.59
PMS1-222ENST00000639501 ERC2O15083 957 aa25.01■■□□□ 1.59
PMS1-222ENST00000639501 MBD3O95983 291 aa25.01■■□□□ 1.59
PMS1-222ENST00000639501 NEK4P51957 841 aa25.01■■□□□ 1.59
PMS1-222ENST00000639501 CDK19Q9BWU1 502 aa25.01■■□□□ 1.59
PMS1-222ENST00000639501 BRD1O95696 1058 aa25■■□□□ 1.59
PMS1-222ENST00000639501 TSC1Q92574 1164 aa25■■□□□ 1.59
PMS1-222ENST00000639501 PTMAP06454 111 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
PMS1-222ENST00000639501 TSPY26PQ9H489 355 aa25■■□□□ 1.59
PMS1-222ENST00000639501 RTL1A6NKG5 1358 aa24.99■■□□□ 1.59
PMS1-222ENST00000639501 IL13P35225 146 aa24.99■■□□□ 1.59
PMS1-222ENST00000639501 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
PMS1-222ENST00000639501 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
PMS1-222ENST00000639501 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
PMS1-222ENST00000639501 MEIS3Q99687 375 aa24.99■■□□□ 1.59
PMS1-222ENST00000639501 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
PMS1-222ENST00000639501 GDPD2Q9HCC8 539 aa24.99■■□□□ 1.59
PMS1-222ENST00000639501 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.98■■□□□ 1.59
PMS1-222ENST00000639501 KIAA2012Q0VF49 1180 aa24.98■■□□□ 1.59
PMS1-222ENST00000639501 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
PMS1-222ENST00000639501 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.97■■□□□ 1.59
PMS1-222ENST00000639501 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
PMS1-222ENST00000639501 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
PMS1-222ENST00000639501 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
PMS1-222ENST00000639501 TSHZ3Q63HK5 1081 aa24.96■■□□□ 1.59
PMS1-222ENST00000639501 PALD1Q9ULE6 856 aa24.96■■□□□ 1.59
PMS1-222ENST00000639501 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
PMS1-222ENST00000639501 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
PMS1-222ENST00000639501 MYRIPQ8NFW9 859 aa24.94■■□□□ 1.58
PMS1-222ENST00000639501 ZRANB1Q9UGI0 708 aa24.94■■□□□ 1.58
PMS1-222ENST00000639501 C3P01024 1663 aa24.93■■□□□ 1.58
PMS1-222ENST00000639501 CUL4AQ13619 759 aa24.93■■□□□ 1.58
PMS1-222ENST00000639501 ZNF710Q8N1W2 664 aa24.93■■□□□ 1.58
PMS1-222ENST00000639501 TNRQ92752 1358 aa24.93■■□□□ 1.58
PMS1-222ENST00000639501 PDE1AP54750 535 aa24.91■■□□□ 1.58
PMS1-222ENST00000639501 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
PMS1-222ENST00000639501 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
PMS1-222ENST00000639501 USP25Q9UHP3 1055 aa24.9■■□□□ 1.58
PMS1-222ENST00000639501 TCHHQ07283 1943 aa24.9■■□□□ 1.58
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