RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606714.5

TRAM2-AS1-204, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 2,453 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ABTB2Q8N961 1025 aa27.33■■□□□ 1.97
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 BECN1Q14457 450 aa27.32■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RGPD1P0DJD0 1748 aa27.32■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CRB1P82279 1406 aa27.31■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PIK3C2AO00443 1686 aa27.3■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GCC1Q96CN9 775 aa27.3■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TSPYL4Q9UJ04 414 aa27.3■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IGSF1Q8N6C5 1336 aa27.29■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HOXC9P31274 260 aa27.28■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 C22orf23Q9BZE7 217 aa27.28■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ANKARQ7Z5J8 1434 aa27.28■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ANKLE2Q86XL3 938 aa27.28■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KIAA0232Q92628 1395 aa27.27■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SLC4A2P04920 1241 aa27.26■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KDRP35968 1356 aa27.26■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TBC1D2Q9BYX2 928 aa27.25■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PHF8Q9UPP1 1060 aa27.25■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GAS2L2Q8NHY3 880 aa27.24■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RGS12O14924 1447 aa27.23■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 USHBP1Q8N6Y0 703 aa27.23■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FMN2Q9NZ56 1722 aa27.22■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PLEKHG5O94827 1062 aa27.22■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa27.22■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZBTB7CA1YPR0 619 aa27.21■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 G2E3Q7L622 706 aa27.21■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MSH6P52701 1360 aa27.2■■□□□ 1.94
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SLC4A10Q6U841 1118 aa27.19■■□□□ 1.94
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KIF24Q5T7B8 1368 aa27.19■■□□□ 1.94
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PTPRCP08575 1304 aa27.18■■□□□ 1.94
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ESCO1Q5FWF5 840 aa27.18■■□□□ 1.94
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 BMP2KLQ5H9B9 411 aa27.18■■□□□ 1.94
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MEIS3Q99687 375 aa27.18■■□□□ 1.94
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 F6X3S4 739 aa27.18■■□□□ 1.94
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NECTIN2Q92692 538 aa27.18■■□□□ 1.94
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GNAT3A8MTJ3 354 aa27.17■■□□□ 1.94
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 APBB1O00213 710 aa27.15■■□□□ 1.94
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PSME1Q06323 249 aa27.15■■□□□ 1.94
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ANKRD44Q8N8A2 993 aa27.14■■□□□ 1.94
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CEP85Q6P2H3 762 aa27.14■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DCTPP1Q9H773 170 aa27.14■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IL17REQ8NFR9 667 aa27.13■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ATP10DQ9P241 1426 aa27.13■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RTL1A6NKG5 1358 aa27.12■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ANTXR1Q9H6X2 564 aa27.12■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NWD1Q149M9 1564 aa27.11■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa27.1■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 STK31Q9BXU1 1019 aa27.1■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MAP3K5Q99683 1374 aa27.09■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa27.09■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NBPF6Q5VWK0 638 aa27.07■■□□□ 1.92
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IP6K1Q92551 441 aa27.07■■□□□ 1.92
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NBPF4Q96M43 638 aa27.07■■□□□ 1.92
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ORAI2Q96SN7 254 aa27.07■■□□□ 1.92
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RBM25P49756 843 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LMOD2Q6P5Q4 547 aa27.05■■□□□ 1.92
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CCDC30Q5VVM6 783 aa27.05■■□□□ 1.92
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa27.04■■□□□ 1.92
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FLIIQ13045 1269 aa27.04■■□□□ 1.92
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CCT4P50991 539 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HSCBQ8IWL3 235 aa27.03■■□□□ 1.92
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CDC45O75419 566 aa27.01■■□□□ 1.91
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TTC22Q5TAA0 569 aa27■■□□□ 1.91
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LGR6Q9HBX8 967 aa27■■□□□ 1.91
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KCNH5Q8NCM2 988 aa26.99■■□□□ 1.91
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NFAT5O94916 1531 aa26.98■■□□□ 1.91
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LRRC37A3O60309 1634 aa26.98■■□□□ 1.91
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 USP54Q70EL1 1684 aa26.97■■□□□ 1.91
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KIF2CQ99661 725 aa26.97■■□□□ 1.91
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HMMRO75330 724 aa26.96■■□□□ 1.91
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GNAI2P04899 355 aa26.96■■□□□ 1.91
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa26.96■■□□□ 1.91
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LTN1O94822 1766 aa26.96■■□□□ 1.91
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GCP02774 474 aa26.95■■□□□ 1.91
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.91
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa26.95■■□□□ 1.9
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