RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TSPYL4Q9UJ04 414 aa14.76□□□□□ -0.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 F6X3S4 739 aa14.76□□□□□ -0.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FLT4P35916 1363 aa14.76□□□□□ -0.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRHP20396 242 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MEIS3Q99687 375 aa14.76□□□□□ -0.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CRB1P82279 1406 aa14.75□□□□□ -0.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ARHGAP23Q9P227 1491 aa14.75□□□□□ -0.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ABTB2Q8N961 1025 aa14.75□□□□□ -0.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RGS12O14924 1447 aa14.75□□□□□ -0.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC4A10Q6U841 1118 aa14.75□□□□□ -0.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IL27Q8NEV9 243 aa14.75□□□□□ -0.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NECTIN2Q92692 538 aa14.75□□□□□ -0.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLIT1O75093 1534 aa14.75□□□□□ -0.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SBNO1A3KN83 1393 aa14.75□□□□□ -0.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PLEKHG5O94827 1062 aa14.74□□□□□ -0.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DIP2AQ14689 1571 aa14.74□□□□□ -0.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa14.74□□□□□ -0.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MSH6P52701 1360 aa14.73□□□□□ -0.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 USHBP1Q8N6Y0 703 aa14.73□□□□□ -0.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DCTPP1Q9H773 170 aa14.73□□□□□ -0.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ARHGEF10O15013 1369 aa14.73□□□□□ -0.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NALCNQ8IZF0 1738 aa14.73□□□□□ -0.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KIAA0232Q92628 1395 aa14.72□□□□□ -0.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGSF1Q8N6C5 1336 aa14.72□□□□□ -0.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HOXC9P31274 260 aa14.72□□□□□ -0.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa14.72□□□□□ -0.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CEP85Q6P2H3 762 aa14.72□□□□□ -0.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RGPD1P0DJD0 1748 aa14.71□□□□□ -0.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RBM25P49756 843 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KDRP35968 1356 aa14.71□□□□□ -0.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ANKRD44Q8N8A2 993 aa14.71□□□□□ -0.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BRPF3Q9ULD4 1205 aa14.7□□□□□ -0.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZBTB7CA1YPR0 619 aa14.7□□□□□ -0.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HSCBQ8IWL3 235 aa14.7□□□□□ -0.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KIF2CQ99661 725 aa14.7□□□□□ -0.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RTL1A6NKG5 1358 aa14.7□□□□□ -0.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ATP10DQ9P241 1426 aa14.7□□□□□ -0.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GAS2L2Q8NHY3 880 aa14.69□□□□□ -0.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PTPRCP08575 1304 aa14.69□□□□□ -0.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa14.69□□□□□ -0.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PIK3C2AO00443 1686 aa14.69□□□□□ -0.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IL17REQ8NFR9 667 aa14.69□□□□□ -0.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GNAT3A8MTJ3 354 aa14.68□□□□□ -0.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KIF24Q5T7B8 1368 aa14.68□□□□□ -0.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FOXD4L1Q9NU39 408 aa14.67□□□□□ -0.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PHF8Q9UPP1 1060 aa14.66□□□□□ -0.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FMN2Q9NZ56 1722 aa14.66□□□□□ -0.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CDC45O75419 566 aa14.65□□□□□ -0.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TTC22Q5TAA0 569 aa14.65□□□□□ -0.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 STK31Q9BXU1 1019 aa14.65□□□□□ -0.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CHMP5Q9NZZ3 219 aa14.65□□□□□ -0.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ESCO1Q5FWF5 840 aa14.65□□□□□ -0.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FLIIQ13045 1269 aa14.64□□□□□ -0.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ANKLE2Q86XL3 938 aa14.64□□□□□ -0.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ARXQ96QS3 562 aa14.64□□□□□ -0.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa14.64□□□□□ -0.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MCM4P33991 863 aa14.63□□□□□ -0.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TSHZ3Q63HK5 1081 aa14.63□□□□□ -0.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SDSP20132 328 aa14.63□□□□□ -0.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NBPF6Q5VWK0 638 aa14.63□□□□□ -0.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SNX21Q969T3 373 aa14.63□□□□□ -0.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NBPF4Q96M43 638 aa14.63□□□□□ -0.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ANKARQ7Z5J8 1434 aa14.63□□□□□ -0.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PSME1Q06323 249 aa14.62□□□□□ -0.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CCT4P50991 539 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CCDC30Q5VVM6 783 aa14.62□□□□□ -0.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LGR6Q9HBX8 967 aa14.62□□□□□ -0.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MAP3K5Q99683 1374 aa14.61□□□□□ -0.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NWD1Q149M9 1564 aa14.61□□□□□ -0.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa14.61□□□□□ -0.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GNAI2P04899 355 aa14.6□□□□□ -0.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LMOD2Q6P5Q4 547 aa14.6□□□□□ -0.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ORAI2Q96SN7 254 aa14.6□□□□□ -0.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HMMRO75330 724 aa14.59□□□□□ -0.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DDIT3P35638 169 aa14.59□□□□□ -0.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IP6K1Q92551 441 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.6 ms