RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557266.5

RCCD1-208, Transcript of RCC1 domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RCCD1, Length 2,110 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1-208ENST00000557266 ARHGEF10O15013 1369 aa28.29■■■□□ 2.12
RCCD1-208ENST00000557266 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa28.28■■■□□ 2.12
RCCD1-208ENST00000557266 CRB1P82279 1406 aa28.28■■■□□ 2.12
RCCD1-208ENST00000557266 IL27Q8NEV9 243 aa28.28■■■□□ 2.12
RCCD1-208ENST00000557266 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
RCCD1-208ENST00000557266 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
RCCD1-208ENST00000557266 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.24■■■□□ 2.11
RCCD1-208ENST00000557266 SBNO1A3KN83 1393 aa28.24■■■□□ 2.11
RCCD1-208ENST00000557266 FLT4P35916 1363 aa28.23■■■□□ 2.11
RCCD1-208ENST00000557266 ATP10DQ9P241 1426 aa28.23■■■□□ 2.11
RCCD1-208ENST00000557266 HSCBQ8IWL3 235 aa28.22■■■□□ 2.11
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RCCD1-208ENST00000557266 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa28.21■■■□□ 2.11
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RCCD1-208ENST00000557266 KDRP35968 1356 aa28.21■■■□□ 2.11
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RCCD1-208ENST00000557266 CHMP5Q9NZZ3 219 aa28.19■■■□□ 2.1
RCCD1-208ENST00000557266 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa28.18■■■□□ 2.1
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RCCD1-208ENST00000557266 CEP85Q6P2H3 762 aa28.15■■■□□ 2.1
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RCCD1-208ENST00000557266 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
RCCD1-208ENST00000557266 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
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RCCD1-208ENST00000557266 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
RCCD1-208ENST00000557266 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
RCCD1-208ENST00000557266 RABEP1Q15276 862 aa27.9■■■□□ 2.06
RCCD1-208ENST00000557266 NECTIN2Q92692 538 aa27.9■■■□□ 2.06
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