RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551059.1

CORO1C-216, Transcript of coronin 1C, humanhuman

TSL 2

Gene CORO1C, Length 474 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CORO1C-216ENST00000551059 SHANK3Q9BYB0 1731 aa25.44■■□□□ 1.66
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CORO1C-216ENST00000551059 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
CORO1C-216ENST00000551059 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
CORO1C-216ENST00000551059 CAMKK2Q96RR4 588 aa25.42■■□□□ 1.66
CORO1C-216ENST00000551059 IGSF1Q8N6C5 1336 aa25.41■■□□□ 1.66
CORO1C-216ENST00000551059 ACSBG1Q96GR2 724 aa25.41■■□□□ 1.66
CORO1C-216ENST00000551059 KCNQ2O43526 872 aa25.39■■□□□ 1.66
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CORO1C-216ENST00000551059 IL13P35225 146 aa25.38■■□□□ 1.65
CORO1C-216ENST00000551059 PARD3Q8TEW0 1356 aa25.37■■□□□ 1.65
CORO1C-216ENST00000551059 PKD1L3Q7Z443 1732 aa25.37■■□□□ 1.65
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CORO1C-216ENST00000551059 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa25.37■■□□□ 1.65
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CORO1C-216ENST00000551059 CYP27B1O15528 508 aa25.33■■□□□ 1.65
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CORO1C-216ENST00000551059 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa25.32■■□□□ 1.64
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CORO1C-216ENST00000551059 AEBP1Q8IUX7 1158 aa25.32■■□□□ 1.64
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CORO1C-216ENST00000551059 SULT6B1Q6IMI4 303 aa25.31■■□□□ 1.64
CORO1C-216ENST00000551059 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa25.31■■□□□ 1.64
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CORO1C-216ENST00000551059 PPP2R1AP30153 589 aa25.3■■□□□ 1.64
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CORO1C-216ENST00000551059 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
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CORO1C-216ENST00000551059 CFAP53Q96M91 514 aa25.25■■□□□ 1.63
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CORO1C-216ENST00000551059 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa25.23■■□□□ 1.63
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CORO1C-216ENST00000551059 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
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CORO1C-216ENST00000551059 ITGB4P16144 1822 aa25.17■■□□□ 1.62
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CORO1C-216ENST00000551059 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
CORO1C-216ENST00000551059 SLC27A3Q5K4L6 730 aa25.11■■□□□ 1.61
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CORO1C-216ENST00000551059 PALLDQ8WX93 1383 aa25.09■■□□□ 1.61
CORO1C-216ENST00000551059 ERVV-2B6SEH9 535 aa25.09■■□□□ 1.61
CORO1C-216ENST00000551059 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
CORO1C-216ENST00000551059 KCNQ4P56696 695 aa25.09■■□□□ 1.61
CORO1C-216ENST00000551059 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP25.09■■□□□ 1.61
CORO1C-216ENST00000551059 STK32BQ9NY57 414 aa25.09■■□□□ 1.61
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CORO1C-216ENST00000551059 PRKAR2BP31323 418 aa25.07■■□□□ 1.6
CORO1C-216ENST00000551059 SLC15A2Q16348 729 aa25.07■■□□□ 1.6
CORO1C-216ENST00000551059 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
CORO1C-216ENST00000551059 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
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CORO1C-216ENST00000551059 ASAP1Q9ULH1 1129 aa25.05■■□□□ 1.6
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CORO1C-216ENST00000551059 ZNF827Q17R98 1081 aa25.03■■□□□ 1.6
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CORO1C-216ENST00000551059 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
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CORO1C-216ENST00000551059 LGR6Q9HBX8 967 aa25.02■■□□□ 1.6
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CORO1C-216ENST00000551059 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa25■■□□□ 1.59
CORO1C-216ENST00000551059 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
CORO1C-216ENST00000551059 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
CORO1C-216ENST00000551059 CASZ1Q86V15 1759 aa24.98■■□□□ 1.59
CORO1C-216ENST00000551059 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa24.98■■□□□ 1.59
CORO1C-216ENST00000551059 MAP3K5Q99683 1374 aa24.98■■□□□ 1.59
CORO1C-216ENST00000551059 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa24.98■■□□□ 1.59
CORO1C-216ENST00000551059 SIK1P57059 783 aa24.98■■□□□ 1.59
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