RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546891.5

CS-205, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 911 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-205ENST00000546891 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
CS-205ENST00000546891 GSE1Q14687 1217 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-205ENST00000546891 AEBP1Q8IUX7 1158 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-205ENST00000546891 HSCBQ8IWL3 235 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-205ENST00000546891 LNPKQ9C0E8 428 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-205ENST00000546891 RBM25P49756 843 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
CS-205ENST00000546891 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-205ENST00000546891 ANKRD45Q5TZF3 282 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-205ENST00000546891 CHMP4AQ9BY43 222 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-205ENST00000546891 TBC1D2Q9BYX2 928 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-205ENST00000546891 PIK3C2AO00443 1686 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-205ENST00000546891 FAM83GA6ND36 823 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-205ENST00000546891 HMMRO75330 724 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-205ENST00000546891 ANKRD44Q8N8A2 993 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-205ENST00000546891 SNX21Q969T3 373 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-205ENST00000546891 LRRC37A3O60309 1634 aa12.19□□□□□ -0.46
CS-205ENST00000546891 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
CS-205ENST00000546891 CCT4P50991 539 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
CS-205ENST00000546891 DCTN1Q14203 1278 aa12.19□□□□□ -0.46
CS-205ENST00000546891 DCTPP1Q9H773 170 aa12.19□□□□□ -0.46
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CS-205ENST00000546891 ANTXR1Q9H6X2 564 aa12.18□□□□□ -0.46
CS-205ENST00000546891 CHMP5Q9NZZ3 219 aa12.18□□□□□ -0.46
CS-205ENST00000546891 TSPYL4Q9UJ04 414 aa12.18□□□□□ -0.46
CS-205ENST00000546891 RGS12O14924 1447 aa12.18□□□□□ -0.46
CS-205ENST00000546891 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
CS-205ENST00000546891 NUTM2FA1L443 756 aa12.17□□□□□ -0.46
CS-205ENST00000546891 HSPA2P54652 639 aa12.17□□□□□ -0.46
CS-205ENST00000546891 MCM10Q7L590 875 aa12.17□□□□□ -0.46
CS-205ENST00000546891 STK31Q9BXU1 1019 aa12.17□□□□□ -0.46
CS-205ENST00000546891 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
CS-205ENST00000546891 ATP10DQ9P241 1426 aa12.17□□□□□ -0.46
CS-205ENST00000546891 PXDNLA1KZ92 1463 aa12.16□□□□□ -0.46
CS-205ENST00000546891 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
CS-205ENST00000546891 PTMSP20962 102 aa12.16□□□□□ -0.46
CS-205ENST00000546891 NLRP6P59044 892 aa12.16□□□□□ -0.46
CS-205ENST00000546891 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
CS-205ENST00000546891 CASC1Q6TDU7 716 aa12.16□□□□□ -0.46
CS-205ENST00000546891 ANKLE2Q86XL3 938 aa12.16□□□□□ -0.46
CS-205ENST00000546891 SIRT2Q8IXJ6 389 aa12.16□□□□□ -0.46
CS-205ENST00000546891 C1orf115Q9H7X2 142 aa12.16□□□□□ -0.46
CS-205ENST00000546891 MAP3K5Q99683 1374 aa12.16□□□□□ -0.46
CS-205ENST00000546891 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-205ENST00000546891 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-205ENST00000546891 GNAT3A8MTJ3 354 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-205ENST00000546891 HOXC9P31274 260 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-205ENST00000546891 CCDC30Q5VVM6 783 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-205ENST00000546891 EYA1Q99502 592 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-205ENST00000546891 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
CS-205ENST00000546891 MSH6P52701 1360 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-205ENST00000546891 LMTK3Q96Q04 1460 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-205ENST00000546891 KCNA6P17658 529 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-205ENST00000546891 CEP85Q6P2H3 762 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-205ENST00000546891 PHF8Q9UPP1 1060 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-205ENST00000546891 SOX12O15370 315 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-205ENST00000546891 TTC22Q5TAA0 569 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-205ENST00000546891 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-205ENST00000546891 ABTB2Q8N961 1025 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-205ENST00000546891 KCNH5Q8NCM2 988 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-205ENST00000546891 NWD1Q149M9 1564 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-205ENST00000546891 DDX11L8A8MPP1 907 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-205ENST00000546891 SLC4A2P04920 1241 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-205ENST00000546891 GNAI3P08754 354 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-205ENST00000546891 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
CS-205ENST00000546891 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
CS-205ENST00000546891 GNAI2P04899 355 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-205ENST00000546891 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
CS-205ENST00000546891 HOXB7P09629 217 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-205ENST00000546891 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
CS-205ENST00000546891 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-205ENST00000546891 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
CS-205ENST00000546891 RABEP1Q15276 862 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-205ENST00000546891 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
CS-205ENST00000546891 IL27Q8NEV9 243 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-205ENST00000546891 IP6K1Q92551 441 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-205ENST00000546891 NFAT5O94916 1531 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-205ENST00000546891 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-205ENST00000546891 NCAPD2Q15021 1401 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-205ENST00000546891 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
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CS-205ENST00000546891 KRT24Q2M2I5 525 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-205ENST00000546891 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
CS-205ENST00000546891 MEIS3Q99687 375 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-205ENST00000546891 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
CS-205ENST00000546891 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
CS-205ENST00000546891 FOXO3O43524 673 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-205ENST00000546891 REC8O95072 547 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-205ENST00000546891 MCM4P33991 863 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-205ENST00000546891 FLIIQ13045 1269 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-205ENST00000546891 GBP4Q96PP9 640 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-205ENST00000546891 OSBPL3Q9H4L5 887 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-205ENST00000546891 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
CS-205ENST00000546891 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
CS-205ENST00000546891 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
CS-205ENST00000546891 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa12.06□□□□□ -0.48
CS-205ENST00000546891 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
CS-205ENST00000546891 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
CS-205ENST00000546891 DDIT3P35638 169 aa12.06□□□□□ -0.48
CS-205ENST00000546891 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
CS-205ENST00000546891 AMOTQ4VCS5 1084 aa12.06□□□□□ -0.48
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