RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545663.5

CLSTN3-216, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 533 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-216ENST00000545663 NMRK2Q9NPI5 230 aa22.48■■□□□ 1.19
CLSTN3-216ENST00000545663 NSD2O96028 1365 aa22.48■■□□□ 1.19
CLSTN3-216ENST00000545663 ANKRD24Q8TF21 1146 aa22.47■■□□□ 1.19
CLSTN3-216ENST00000545663 QRICH2Q9H0J4 1663 aa22.46■■□□□ 1.19
CLSTN3-216ENST00000545663 LY75O60449 1722 aa22.45■■□□□ 1.18
CLSTN3-216ENST00000545663 WDR90Q96KV7 1748 aa22.45■■□□□ 1.18
CLSTN3-216ENST00000545663 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa22.44■■□□□ 1.18
CLSTN3-216ENST00000545663 SMIM5Q71RC9 77 aa22.42■■□□□ 1.18
CLSTN3-216ENST00000545663 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
CLSTN3-216ENST00000545663 TTC21AQ8NDW8 1320 aa22.41■■□□□ 1.18
CLSTN3-216ENST00000545663 SLC34A2O95436 690 aa22.41■■□□□ 1.18
CLSTN3-216ENST00000545663 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.41■■□□□ 1.18
CLSTN3-216ENST00000545663 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.17
CLSTN3-216ENST00000545663 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CLSTN3-216ENST00000545663 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.37■■□□□ 1.17
CLSTN3-216ENST00000545663 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
CLSTN3-216ENST00000545663 NME9Q86XW9 330 aa22.35■■□□□ 1.17
CLSTN3-216ENST00000545663 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
CLSTN3-216ENST00000545663 USP47Q96K76 1375 aa22.35■■□□□ 1.17
CLSTN3-216ENST00000545663 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.34■■□□□ 1.17
CLSTN3-216ENST00000545663 EVC2Q86UK5 1308 aa22.33■■□□□ 1.17
CLSTN3-216ENST00000545663 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.33■■□□□ 1.17
CLSTN3-216ENST00000545663 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.33■■□□□ 1.17
CLSTN3-216ENST00000545663 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
CLSTN3-216ENST00000545663 PHF14O94880 888 aa22.32■■□□□ 1.16
CLSTN3-216ENST00000545663 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa22.31■■□□□ 1.16
CLSTN3-216ENST00000545663 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
CLSTN3-216ENST00000545663 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
CLSTN3-216ENST00000545663 LTN1O94822 1766 aa22.3■■□□□ 1.16
CLSTN3-216ENST00000545663 USP31Q70CQ4 1352 aa22.3■■□□□ 1.16
CLSTN3-216ENST00000545663 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CLSTN3-216ENST00000545663 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CLSTN3-216ENST00000545663 FSTL1Q12841 308 aa22.3■■□□□ 1.16
CLSTN3-216ENST00000545663 C5P01031 1676 aa22.3■■□□□ 1.16
CLSTN3-216ENST00000545663 BCS1LQ9Y276 419 aa22.29■■□□□ 1.16
CLSTN3-216ENST00000545663 USP54Q70EL1 1684 aa22.28■■□□□ 1.16
CLSTN3-216ENST00000545663 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CLSTN3-216ENST00000545663 A0A0G2JLW4 131 aa22.27■■□□□ 1.16
CLSTN3-216ENST00000545663 AK7Q96M32 723 aa22.26■■□□□ 1.15
CLSTN3-216ENST00000545663 C9orf131Q5VYM1 1079 aa22.25■■□□□ 1.15
CLSTN3-216ENST00000545663 IP6K1Q92551 441 aa22.25■■□□□ 1.15
CLSTN3-216ENST00000545663 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.25■■□□□ 1.15
CLSTN3-216ENST00000545663 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.24■■□□□ 1.15
CLSTN3-216ENST00000545663 RRAGCQ9HB90 399 aa22.24■■□□□ 1.15
CLSTN3-216ENST00000545663 MEGF6O75095 1541 aa22.24■■□□□ 1.15
CLSTN3-216ENST00000545663 PALLDQ8WX93 1383 aa22.24■■□□□ 1.15
CLSTN3-216ENST00000545663 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa22.22■■□□□ 1.15
CLSTN3-216ENST00000545663 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.22■■□□□ 1.15
CLSTN3-216ENST00000545663 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.21■■□□□ 1.15
CLSTN3-216ENST00000545663 C4BP0C0L5 1744 aa22.21■■□□□ 1.15
CLSTN3-216ENST00000545663 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.21■■□□□ 1.15
CLSTN3-216ENST00000545663 MMP10P09238 476 aa22.2■■□□□ 1.14
CLSTN3-216ENST00000545663 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CLSTN3-216ENST00000545663 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.18■■□□□ 1.14
CLSTN3-216ENST00000545663 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.18■■□□□ 1.14
CLSTN3-216ENST00000545663 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CLSTN3-216ENST00000545663 FCHSD2O94868 740 aa22.18■■□□□ 1.14
CLSTN3-216ENST00000545663 DPEP1P16444 411 aa22.18■■□□□ 1.14
CLSTN3-216ENST00000545663 FBLN1P23142 703 aa22.18■■□□□ 1.14
CLSTN3-216ENST00000545663 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.16■■□□□ 1.14
CLSTN3-216ENST00000545663 UBR3Q6ZT12 1888 aa22.16■■□□□ 1.14
CLSTN3-216ENST00000545663 TGFB2P61812 414 aa22.16■■□□□ 1.14
CLSTN3-216ENST00000545663 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.16■■□□□ 1.14
CLSTN3-216ENST00000545663 SMC1BQ8NDV3 1235 aa22.16■■□□□ 1.14
CLSTN3-216ENST00000545663 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.15■■□□□ 1.14
CLSTN3-216ENST00000545663 SSFA2P28290 1259 aa22.15■■□□□ 1.14
CLSTN3-216ENST00000545663 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.15■■□□□ 1.14
CLSTN3-216ENST00000545663 RGPD2P0DJD1 1756 aa22.15■■□□□ 1.14
CLSTN3-216ENST00000545663 NBPF6Q5VWK0 638 aa22.14■■□□□ 1.13
CLSTN3-216ENST00000545663 NBPF4Q96M43 638 aa22.14■■□□□ 1.13
CLSTN3-216ENST00000545663 HOXC9P31274 260 aa22.13■■□□□ 1.13
CLSTN3-216ENST00000545663 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.12■■□□□ 1.13
CLSTN3-216ENST00000545663 RNF181Q9P0P0 153 aa22.12■■□□□ 1.13
CLSTN3-216ENST00000545663 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.12■■□□□ 1.13
CLSTN3-216ENST00000545663 KCNA3P22001 575 aa22.11■■□□□ 1.13
CLSTN3-216ENST00000545663 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CLSTN3-216ENST00000545663 TMC1Q8TDI8 760 aa22.11■■□□□ 1.13
CLSTN3-216ENST00000545663 GNPATO15228 680 aa22.1■■□□□ 1.13
CLSTN3-216ENST00000545663 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.1■■□□□ 1.13
CLSTN3-216ENST00000545663 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.1■■□□□ 1.13
CLSTN3-216ENST00000545663 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.09■■□□□ 1.13
CLSTN3-216ENST00000545663 AMPHP49418 695 aa22.09■■□□□ 1.13
CLSTN3-216ENST00000545663 PIGBQ92521 554 aa22.09■■□□□ 1.13
CLSTN3-216ENST00000545663 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CLSTN3-216ENST00000545663 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.08■■□□□ 1.13
CLSTN3-216ENST00000545663 ITPK1Q13572 414 aa22.08■■□□□ 1.13
CLSTN3-216ENST00000545663 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.07■■□□□ 1.12
CLSTN3-216ENST00000545663 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.06■■□□□ 1.12
CLSTN3-216ENST00000545663 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.06■■□□□ 1.12
CLSTN3-216ENST00000545663 CYP27B1O15528 508 aa22.06■■□□□ 1.12
CLSTN3-216ENST00000545663 SIK1P57059 783 aa22.06■■□□□ 1.12
CLSTN3-216ENST00000545663 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CLSTN3-216ENST00000545663 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CLSTN3-216ENST00000545663 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.05■■□□□ 1.12
CLSTN3-216ENST00000545663 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
CLSTN3-216ENST00000545663 DCAF5Q96JK2 942 aa22.04■■□□□ 1.12
CLSTN3-216ENST00000545663 PCDH10Q9P2E7 1040 aa22.04■■□□□ 1.12
CLSTN3-216ENST00000545663 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.04■■□□□ 1.12
CLSTN3-216ENST00000545663 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.04■■□□□ 1.12
CLSTN3-216ENST00000545663 FOXN1O15353 648 aa22.03■■□□□ 1.12
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