RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 E9PCH4 1651 aa15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1-211ENST00000503687 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1-211ENST00000503687 ANKLE2Q86XL3 938 aa15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1-211ENST00000503687 GNAT3A8MTJ3 354 aa15.52■□□□□ 0.08
RABGEF1-211ENST00000503687 FLIIQ13045 1269 aa15.52■□□□□ 0.08
RABGEF1-211ENST00000503687 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP15.52■□□□□ 0.08
RABGEF1-211ENST00000503687 RIC3Q7Z5B4 369 aa15.52■□□□□ 0.08
RABGEF1-211ENST00000503687 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
RABGEF1-211ENST00000503687 PPP6R1Q9UPN7 881 aa15.52■□□□□ 0.08
RABGEF1-211ENST00000503687 IL13P35225 146 aa15.52■□□□□ 0.07
RABGEF1-211ENST00000503687 SMC3Q9UQE7 1217 aa15.52■□□□□ 0.07
RABGEF1-211ENST00000503687 FIBPO43427 364 aa15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1-211ENST00000503687 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1-211ENST00000503687 GORABQ5T7V8 394 aa15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1-211ENST00000503687 TTC22Q5TAA0 569 aa15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1-211ENST00000503687 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1-211ENST00000503687 LTKP29376 864 aa15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1-211ENST00000503687 KIAA2012Q0VF49 1180 aa15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1-211ENST00000503687 MYL6BP14649 208 aa15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1-211ENST00000503687 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1-211ENST00000503687 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1-211ENST00000503687 MX1P20591 662 aa15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1-211ENST00000503687 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1-211ENST00000503687 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1-211ENST00000503687 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1-211ENST00000503687 USP19O94966 1318 aa15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1-211ENST00000503687 ESPNB1AK53 854 aa15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1-211ENST00000503687 ARHGAP45Q92619 1136 aa15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1-211ENST00000503687 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1-211ENST00000503687 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1-211ENST00000503687 NEXNQ0ZGT2 675 aa15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1-211ENST00000503687 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1-211ENST00000503687 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1-211ENST00000503687 SYCE3A1L190 88 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1-211ENST00000503687 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1-211ENST00000503687 ANKRD44Q8N8A2 993 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1-211ENST00000503687 BAG4O95429 457 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
RABGEF1-211ENST00000503687 CHMP4AQ9BY43 222 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGEF1-211ENST00000503687 TET3O43151 1660 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGEF1-211ENST00000503687 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
RABGEF1-211ENST00000503687 RUFY2Q8WXA3 655 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM13BQ9NYF5 915 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGEF1-211ENST00000503687 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGEF1-211ENST00000503687 CNTROBQ8N137 903 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGEF1-211ENST00000503687 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGEF1-211ENST00000503687 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
RABGEF1-211ENST00000503687 CEP85Q6P2H3 762 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGEF1-211ENST00000503687 TTC5Q8N0Z6 440 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGEF1-211ENST00000503687 NEUROD6Q96NK8 337 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGEF1-211ENST00000503687 DCTPP1Q9H773 170 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGEF1-211ENST00000503687 EFCAB6Q5THR3 1501 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGEF1-211ENST00000503687 BTBD11A6QL63 1104 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGEF1-211ENST00000503687 SPG7Q9UQ90 795 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGEF1-211ENST00000503687 HECW2Q9P2P5 1572 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGEF1-211ENST00000503687 KIF1BO60333 1816 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGEF1-211ENST00000503687 KCNA6P17658 529 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGEF1-211ENST00000503687 STK3Q13188 491 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGEF1-211ENST00000503687 FBXW7Q969H0 707 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGEF1-211ENST00000503687 ABCA9Q8IUA7 1624 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGEF1-211ENST00000503687 TAF7LQ5H9L4 462 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGEF1-211ENST00000503687 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
RABGEF1-211ENST00000503687 FSD1Q9BTV5 496 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGEF1-211ENST00000503687 HDAC5Q9UQL6 1122 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGEF1-211ENST00000503687 METP08581 1390 aa15.46■□□□□ 0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 ABCC3O15438 1527 aa15.46■□□□□ 0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 EYA1Q99502 592 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 SYNMO15061 1565 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 PI4KAP2A4QPH2 592 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 PDE1AP54750 535 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 MAP3K19Q56UN5 1328 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 CHAMP1Q96JM3 812 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 DDX58O95786 925 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 ATF3P18847 181 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 H3BQV1 296 aa15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 IFFO2Q5TF58 517 aa15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 PHF14O94880 888 aa15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 FERMT3Q86UX7 667 aa15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 AACSQ86V21 672 aa15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 CEP152O94986 1710 aa15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 ARAP3Q8WWN8 1544 aa15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 RBM10P98175 930 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM184AQ8NB25 1140 aa15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 PHF8Q9UPP1 1060 aa15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 PTPRCP08575 1304 aa15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 KDM4AO75164 1064 aa15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 MYOM2P54296 1465 aa15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1-211ENST00000503687 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103.9 ms